More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0963 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
257 aa  531  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  73.93 
 
 
257 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  73.54 
 
 
257 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  70.74 
 
 
233 aa  322  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  65.86 
 
 
258 aa  314  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.57 
 
 
257 aa  307  9e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.08 
 
 
259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.73 
 
 
259 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.52 
 
 
261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.94 
 
 
259 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  57.14 
 
 
255 aa  301  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  56.3 
 
 
263 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  56.92 
 
 
288 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.2 
 
 
274 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  58.66 
 
 
263 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.27 
 
 
259 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.48 
 
 
259 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  62.35 
 
 
257 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.84 
 
 
274 aa  291  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  56.68 
 
 
253 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.04 
 
 
265 aa  285  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.04 
 
 
265 aa  285  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  54.3 
 
 
256 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  53.91 
 
 
256 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  54.3 
 
 
256 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  53.52 
 
 
256 aa  278  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  56.3 
 
 
267 aa  277  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  54.55 
 
 
255 aa  275  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  52.73 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.78 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.99 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.22 
 
 
255 aa  271  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.22 
 
 
251 aa  270  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.24 
 
 
255 aa  268  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.61 
 
 
255 aa  266  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.81 
 
 
256 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.07 
 
 
249 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.03 
 
 
254 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.63 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.63 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.6 
 
 
258 aa  251  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.2 
 
 
257 aa  246  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.22 
 
 
256 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.2 
 
 
261 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.02 
 
 
209 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.84 
 
 
263 aa  210  2e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.46 
 
 
263 aa  209  4e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.54 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  36.95 
 
 
253 aa  156  3e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1238  NAD(+) kinase  31.43 
 
 
312 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0877  ATP-NAD/AcoX kinase  27.4 
 
 
261 aa  89  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  36 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.64 
 
 
300 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.26 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1454  NAD(+) kinase  34.67 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0456787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.8 
 
 
300 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0744  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.09 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.638835  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0669  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.09 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1358  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.09 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.63625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.33 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2370  ATP-NAD/AcoX kinase  33.33 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  31.25 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.02 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.87 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0657  NAD(+) kinase  31.14 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.02 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.02 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  27.59 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13131  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.53 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.611146  normal  0.284729 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.02 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  33.33 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  34.65 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  28.44 
 
 
293 aa  79  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  33.75 
 
 
295 aa  79  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3095  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.33 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1333  ATP-NAD/AcoX kinase  28.97 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.02 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19331  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.62 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1912  NAD(+) kinase  33.75 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0428  hypothetical protein  30.92 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1495  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.13 
 
 
302 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  25.89 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.02 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2975  ATP-NAD/AcoX kinase  32.58 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000435253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.7 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.53 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1028  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.96 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0835  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.14 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  30 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.53 
 
 
344 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.53 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2170  ATP-NAD/AcoX kinase  32.47 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00216575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.53 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16881  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.14 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2618  NAD(+) kinase  30.28 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2356  ATP-NAD/AcoX kinase  34.67 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0719197  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0840  NAD(+) kinase  36.25 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.947583  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1092  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.96 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.886083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1377  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.58 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000779832  normal  0.0588551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>