More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1521 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  62.6 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.42 
 
 
261 aa  305  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  55.56 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  51.76 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  55.34 
 
 
255 aa  265  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  53.75 
 
 
256 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  53.75 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  53.75 
 
 
256 aa  258  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  54.15 
 
 
253 aa  257  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.99 
 
 
257 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  51.38 
 
 
263 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.59 
 
 
257 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.98 
 
 
259 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.19 
 
 
257 aa  254  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.98 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.12 
 
 
256 aa  253  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.52 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  55.51 
 
 
267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.99 
 
 
261 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.98 
 
 
259 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.59 
 
 
274 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.72 
 
 
255 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.19 
 
 
274 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.78 
 
 
259 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  50.2 
 
 
256 aa  244  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.39 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  51.19 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  50.2 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.97 
 
 
257 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  49.8 
 
 
251 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.17 
 
 
259 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.31 
 
 
254 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  49.61 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.92 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.99 
 
 
269 aa  238  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.92 
 
 
254 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  49.21 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  45.82 
 
 
257 aa  232  5e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.6 
 
 
258 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.97 
 
 
257 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  49.6 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  49.6 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  50.43 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.3 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  45.05 
 
 
263 aa  210  1e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.92 
 
 
209 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.54 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  35.18 
 
 
253 aa  157  2e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2191  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.84 
 
 
275 aa  92  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0499  NAD(+) kinase  37.91 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1094  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.4 
 
 
278 aa  87  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.06039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  32.61 
 
 
285 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2371  ATP-NAD/AcoX kinase  35.36 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2356  ATP-NAD/AcoX kinase  40.4 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0719197  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1591  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase, putative  33.33 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306581  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0840  NAD(+) kinase  36.09 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.947583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  44.87 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1049  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.14 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0798943  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0877  ATP-NAD/AcoX kinase  26.58 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0924  ATP-NAD/AcoX kinase  36.57 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000123644  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  34.48 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0657  NAD(+) kinase  34.64 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1579  NAD(+) kinase  32.12 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1238  NAD(+) kinase  37.13 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1352  NAD(+) kinase  36.08 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0123507  normal  0.0209286 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53028  protein involved in oxidative stress  35.84 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.61 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0428  hypothetical protein  38.16 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1521  ATP-NAD/AcoX kinase  34.86 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0965149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4438  ATP-NAD/AcoX kinase  38.86 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0396483  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  35.85 
 
 
302 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.58 
 
 
295 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000972456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.58 
 
 
295 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000172182  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0798  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.78 
 
 
567 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.31 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.22 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1752  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.21 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.000623558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  41.56 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.58 
 
 
315 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  37.5 
 
 
287 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.31 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.31 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1912  NAD(+) kinase  41.56 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.58 
 
 
296 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.89 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.87 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31092  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11710  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.07 
 
 
307 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0469837  normal  0.194229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6912  ATP-NAD/AcoX kinase  39.57 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3159  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.79 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362338  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1246  NAD(+) kinase  37.89 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.641624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2370  ATP-NAD/AcoX kinase  33.11 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3217  NAD(+) kinase  37.18 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  36.13 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0019  putative NAD+ kinase  33.54 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1137  ATP-NAD/AcoX kinase  36.71 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3791  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2165  ATP-NAD/AcoX kinase  31.13 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0353  ATP-NAD/AcoX kinase  28.42 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0629  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.98 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.376086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1040  ATP-NAD/AcoX kinase  39.33 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831572  normal  0.0555439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>