More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3159 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3159  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
299 aa  586  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362338  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1752  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  84.75 
 
 
295 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.000623558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2170  ATP-NAD/AcoX kinase  66.09 
 
 
303 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00216575  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2481  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.81 
 
 
319 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2033  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.13 
 
 
326 aa  339  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6057  sugar kinase-like protein  60.47 
 
 
301 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2012  ATP-NAD/AcoX kinase  62.84 
 
 
301 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3026  ATP-NAD/AcoX kinase  58.47 
 
 
308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.241982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1912  NAD(+) kinase  59.73 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  57.82 
 
 
301 aa  318  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  58.9 
 
 
295 aa  317  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25460  predicted sugar kinase  56.39 
 
 
306 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.7 
 
 
340 aa  308  8e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1516  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.95 
 
 
346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000349412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12380  predicted sugar kinase  55.03 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.497915  normal  0.271294 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3148  ATP-NAD/AcoX kinase  57 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0248504  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5440  NAD(+) kinase  58.7 
 
 
300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175951  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3011  ATP-NAD/AcoX kinase  54.3 
 
 
344 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2965  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.77 
 
 
307 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.165365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2950  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.77 
 
 
307 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2994  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.77 
 
 
307 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120797  normal  0.388285 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1246  NAD(+) kinase  52.92 
 
 
296 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.641624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2356  ATP-NAD/AcoX kinase  53.74 
 
 
297 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0719197  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3508  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.77 
 
 
314 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0877111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4073  ATP-NAD/AcoX kinase  51.19 
 
 
296 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4438  ATP-NAD/AcoX kinase  53.1 
 
 
297 aa  285  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0396483  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3289  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.81 
 
 
306 aa  281  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903838  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11710  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.79 
 
 
307 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0469837  normal  0.194229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2382  ATP-NAD/AcoX kinase  51.88 
 
 
295 aa  275  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14220  predicted sugar kinase  51.01 
 
 
362 aa  274  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563897  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1341  NAD(+) kinase  50.85 
 
 
343 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22140  predicted sugar kinase  50.5 
 
 
327 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218778  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2827  ATP-NAD/AcoX kinase  52.45 
 
 
339 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1658  ATP-NAD/AcoX kinase  49.49 
 
 
290 aa  259  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.059696  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13660  predicted sugar kinase  53.94 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0680  NAD(+)/NADH kinase  43.1 
 
 
307 aa  240  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1125  NAD(+) kinase  47.32 
 
 
319 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0794  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.38 
 
 
340 aa  229  5e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0668234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.93 
 
 
295 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1137  ATP-NAD/AcoX kinase  40.49 
 
 
271 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3791  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1029  NAD(+) kinase  36.61 
 
 
283 aa  155  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.501907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.5 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2738  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.78 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.86 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.86 
 
 
296 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.86 
 
 
315 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2876  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.44 
 
 
295 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.86 
 
 
296 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06550  ATP-NAD/AcoX kinase  34.63 
 
 
260 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000264989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.78 
 
 
295 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000172182  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.78 
 
 
295 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000972456  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0584  NAD(+) kinase  35.91 
 
 
268 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.96 
 
 
296 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.96 
 
 
296 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.96 
 
 
296 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  34.94 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0867  NAD(+) kinase  35.85 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0499  NAD(+) kinase  32.37 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  34.94 
 
 
288 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  31 
 
 
285 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  34.39 
 
 
288 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1643  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.58 
 
 
339 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000729399  hitchhiker  0.000860792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1692  ATP-NAD/AcoX kinase  29.79 
 
 
286 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.121225  hitchhiker  0.00242245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  33.01 
 
 
290 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1509  NAD(+) kinase  35.47 
 
 
311 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004294  NAD kinase  29.31 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1465  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.11 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126818  hitchhiker  0.0000284944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2163  ATP-NAD/AcoX kinase  29.71 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0199773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6912  ATP-NAD/AcoX kinase  36.29 
 
 
285 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2888  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.43 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.4384500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2304  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.5 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.509597 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1377  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.43 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000779832  normal  0.0588551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.34 
 
 
293 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01131  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.97 
 
 
294 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0718  NAD(+) kinase  34.52 
 
 
283 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2065  ATP-NAD kinase  36.12 
 
 
284 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0428793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1617  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.22 
 
 
340 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.771585  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2072  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.56 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  31.86 
 
 
290 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  34.82 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  34.91 
 
 
285 aa  135  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1043  ATP-NAD/AcoX kinase  34.93 
 
 
275 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  36.4 
 
 
290 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  30.92 
 
 
301 aa  135  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.05 
 
 
292 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000370492  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  38.39 
 
 
288 aa  135  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0669  ATP-NAD/AcoX kinase  36.22 
 
 
294 aa  135  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.935643  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19331  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.27 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14541  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.87 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0941  ATP-NAD/AcoX kinase  34.32 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1363  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.87 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14681  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.45 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0650  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.66 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  32.43 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0900  ATP-NAD/AcoX kinase  37.75 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000200756  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1715  NAD(+) kinase  31.47 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2975  ATP-NAD/AcoX kinase  32.47 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000435253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0915  NAD(+) kinase  29.27 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.895385  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14301  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.45 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  34.86 
 
 
292 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>