More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2031 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  100 
 
 
290 aa  590  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  53.66 
 
 
293 aa  315  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  52.96 
 
 
290 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  50.35 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  48.41 
 
 
312 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  48.06 
 
 
312 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  48.06 
 
 
302 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  46.85 
 
 
318 aa  285  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  46.13 
 
 
300 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2422  NAD(+)/NADH kinase family protein  46.85 
 
 
294 aa  277  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  45.42 
 
 
300 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  46.48 
 
 
299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  46.13 
 
 
300 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  46.13 
 
 
345 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  46.13 
 
 
345 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  46.48 
 
 
300 aa  271  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1302  NAD(+)/NADH kinase family protein  44.44 
 
 
291 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0908  NAD(+)/NADH kinase family protein  44.1 
 
 
291 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.42987  normal  0.404915 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  45.77 
 
 
300 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  45.77 
 
 
300 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  45.77 
 
 
344 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  45.77 
 
 
320 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  44.72 
 
 
301 aa  268  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2640  NAD(+)/NADH kinase family protein  46.13 
 
 
300 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42258  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  46.48 
 
 
300 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  46.48 
 
 
300 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  44.01 
 
 
300 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0999  NAD(+)/NADH kinase family protein  48.06 
 
 
313 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.893596  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  44.01 
 
 
301 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0260  NAD(+)/NADH kinase family protein  45.42 
 
 
300 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0744  NAD(+)/NADH kinase family protein  45.42 
 
 
300 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  45.07 
 
 
300 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5420  NAD(+)/NADH kinase family protein  43.73 
 
 
298 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1651  NAD(+)/NADH kinase family protein  43.73 
 
 
298 aa  259  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  43 
 
 
298 aa  258  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  45.8 
 
 
294 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  42.66 
 
 
298 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3601  NAD(+)/NADH kinase family protein  42.71 
 
 
298 aa  254  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672502 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.25 
 
 
293 aa  251  8.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0964  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.92 
 
 
298 aa  251  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000412128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0729  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.92 
 
 
298 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0279623  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3488  NAD(+)/NADH kinase family protein  44.37 
 
 
306 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000826356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  45.02 
 
 
295 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000972456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  45.02 
 
 
295 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000172182  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3297  ATP-NAD/AcoX kinase  41.58 
 
 
292 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0523073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.79 
 
 
295 aa  248  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  45.17 
 
 
295 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.79 
 
 
315 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.79 
 
 
296 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1051  NAD(+)/NADH kinase family protein  41.98 
 
 
298 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.45 
 
 
296 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.45 
 
 
296 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1377  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.16 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000779832  normal  0.0588551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2888  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.16 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.4384500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1715  NAD(+) kinase  42.36 
 
 
291 aa  241  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.58 
 
 
292 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000258302  normal  0.101663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1859  hypothetical protein  44.75 
 
 
290 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.72 
 
 
296 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3334  NAD(+)/NADH kinase family protein  41.78 
 
 
301 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2072  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.36 
 
 
294 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.72 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3217  NAD(+) kinase  40.21 
 
 
292 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.66 
 
 
296 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  43.64 
 
 
292 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1384  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.81 
 
 
299 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0162292  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3824  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.24 
 
 
293 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3009  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.42 
 
 
292 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2898  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.42 
 
 
292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2896  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.42 
 
 
292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.72588  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2827  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.42 
 
 
292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000328242  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02268  NAD kinase  40.69 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0867  NAD(+) kinase  41.72 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2878  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.42 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.126338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3095  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.86 
 
 
292 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1445  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.46 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00237626  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4336  NAD(+)/NADH kinase family protein  40.67 
 
 
303 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2792  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.1 
 
 
309 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000237572  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.41 
 
 
292 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.07 
 
 
292 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000128996  normal  0.109172 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02503  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.07 
 
 
292 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000896223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1060  ATP-NAD/AcoX kinase  40.07 
 
 
292 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000577429  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3004  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.07 
 
 
292 aa  229  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2899  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.07 
 
 
292 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1069  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.07 
 
 
292 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0224782  normal  0.0704222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.07 
 
 
292 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000144313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02467  hypothetical protein  40.07 
 
 
292 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000137745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2975  ATP-NAD/AcoX kinase  44 
 
 
255 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000435253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1479  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43 
 
 
307 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3855  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.52 
 
 
292 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000447787  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  39.72 
 
 
303 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2806  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.41 
 
 
309 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126891  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.41 
 
 
309 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000229952  normal  0.0349698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1190  NAD(+) kinase  40.75 
 
 
293 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0379  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.34 
 
 
294 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.520886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.41 
 
 
309 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000296073  normal  0.942574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.95 
 
 
297 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1523  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.07 
 
 
292 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01131  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.96 
 
 
294 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3006  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.07 
 
 
292 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000540691  hitchhiker  0.000000451072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1355  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.07 
 
 
309 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000052487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>