More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1752 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1752  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
295 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.000623558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3159  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  84.75 
 
 
299 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362338  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2170  ATP-NAD/AcoX kinase  63.79 
 
 
303 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00216575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6057  sugar kinase-like protein  61.82 
 
 
301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2481  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.6 
 
 
319 aa  339  4e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2033  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.61 
 
 
326 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  59.59 
 
 
295 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1912  NAD(+) kinase  59.59 
 
 
308 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2012  ATP-NAD/AcoX kinase  61.49 
 
 
301 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3026  ATP-NAD/AcoX kinase  59.33 
 
 
308 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.241982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  58.16 
 
 
301 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25460  predicted sugar kinase  57.86 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12380  predicted sugar kinase  55.29 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.497915  normal  0.271294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1516  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.67 
 
 
346 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000349412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.03 
 
 
340 aa  301  7.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5440  NAD(+) kinase  57.38 
 
 
300 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3148  ATP-NAD/AcoX kinase  57.34 
 
 
312 aa  300  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0248504  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2965  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.79 
 
 
307 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.165365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2950  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.79 
 
 
307 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2994  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.79 
 
 
307 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120797  normal  0.388285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2356  ATP-NAD/AcoX kinase  54.3 
 
 
297 aa  291  6e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0719197  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3508  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.14 
 
 
314 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0877111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1246  NAD(+) kinase  51.53 
 
 
296 aa  289  4e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.641624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11710  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.46 
 
 
307 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0469837  normal  0.194229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3289  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.48 
 
 
306 aa  285  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903838  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3011  ATP-NAD/AcoX kinase  52.23 
 
 
344 aa  282  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4073  ATP-NAD/AcoX kinase  50.52 
 
 
296 aa  281  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4438  ATP-NAD/AcoX kinase  54.14 
 
 
297 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0396483  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2382  ATP-NAD/AcoX kinase  52.58 
 
 
295 aa  278  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1341  NAD(+) kinase  51.36 
 
 
343 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14220  predicted sugar kinase  50 
 
 
362 aa  268  7e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563897  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1658  ATP-NAD/AcoX kinase  49.66 
 
 
290 aa  266  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.059696  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2827  ATP-NAD/AcoX kinase  45.71 
 
 
339 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22140  predicted sugar kinase  50.51 
 
 
327 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218778  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13660  predicted sugar kinase  48.24 
 
 
314 aa  258  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0680  NAD(+)/NADH kinase  42.57 
 
 
307 aa  240  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0794  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  45.21 
 
 
340 aa  235  6e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0668234  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1125  NAD(+) kinase  46.64 
 
 
319 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0584  NAD(+) kinase  37.27 
 
 
268 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1029  NAD(+) kinase  36 
 
 
283 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.501907  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06550  ATP-NAD/AcoX kinase  33.78 
 
 
260 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000264989  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1137  ATP-NAD/AcoX kinase  38.21 
 
 
271 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3791  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.3 
 
 
295 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1692  ATP-NAD/AcoX kinase  31.91 
 
 
286 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.121225  hitchhiker  0.00242245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.87 
 
 
295 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.87 
 
 
296 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.87 
 
 
296 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.87 
 
 
315 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  33.21 
 
 
288 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.87 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  32.23 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  33.58 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.02 
 
 
295 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000972456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.02 
 
 
295 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000172182  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.21 
 
 
296 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.97 
 
 
296 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  32.93 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.13 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1509  NAD(+) kinase  35.32 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  35.12 
 
 
290 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1377  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.97 
 
 
293 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000779832  normal  0.0588551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2888  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.97 
 
 
293 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.4384500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2065  ATP-NAD kinase  37 
 
 
284 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0428793  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0867  NAD(+) kinase  34.91 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6912  ATP-NAD/AcoX kinase  39.91 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.05 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000370492  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0499  NAD(+) kinase  35.02 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.94 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000258302  normal  0.101663 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1643  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.49 
 
 
339 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000729399  hitchhiker  0.000860792 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2876  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.07 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  32.74 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2738  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.07 
 
 
295 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1465  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.49 
 
 
339 aa  139  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126818  hitchhiker  0.0000284944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1715  NAD(+) kinase  30.66 
 
 
291 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004294  NAD kinase  30 
 
 
294 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2163  ATP-NAD/AcoX kinase  29.69 
 
 
293 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0199773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0955  ATP-NAD/AcoX kinase  33.8 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.02 
 
 
293 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  32.27 
 
 
301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  32.73 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1617  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.09 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.771585  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2681  ATP-NAD/AcoX kinase  36.32 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  32.95 
 
 
309 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0964  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.03 
 
 
298 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000412128  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  33.58 
 
 
290 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  35.93 
 
 
285 aa  136  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1190  NAD(+) kinase  34.11 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0611  ATP-dependent NAD kinase  35.02 
 
 
301 aa  135  7.000000000000001e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0669  ATP-NAD/AcoX kinase  38.07 
 
 
294 aa  135  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.935643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1355  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.07 
 
 
309 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000052487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1341  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.07 
 
 
309 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000175505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1378  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.07 
 
 
309 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2975  ATP-NAD/AcoX kinase  34.04 
 
 
255 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000435253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3006  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.1 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000540691  hitchhiker  0.000000451072 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1591  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase, putative  28.47 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306581  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  33.92 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2304  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.47 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.509597 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02268  NAD kinase  30.03 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0941  ATP-NAD/AcoX kinase  34.68 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  28.95 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>