More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2033 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2033  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
326 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3026  ATP-NAD/AcoX kinase  76.64 
 
 
308 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.241982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2170  ATP-NAD/AcoX kinase  66.89 
 
 
303 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00216575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6057  sugar kinase-like protein  66.23 
 
 
301 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2012  ATP-NAD/AcoX kinase  65.58 
 
 
301 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2481  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.97 
 
 
319 aa  358  8e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1912  NAD(+) kinase  58.44 
 
 
308 aa  339  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3159  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.13 
 
 
299 aa  339  5e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362338  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  59.14 
 
 
295 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.94 
 
 
340 aa  332  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  58.55 
 
 
301 aa  330  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1516  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.94 
 
 
346 aa  331  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000349412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1752  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.61 
 
 
295 aa  328  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.000623558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12380  predicted sugar kinase  55.41 
 
 
315 aa  319  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.497915  normal  0.271294 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3148  ATP-NAD/AcoX kinase  57.33 
 
 
312 aa  315  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0248504  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5440  NAD(+) kinase  55.63 
 
 
300 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25460  predicted sugar kinase  54.43 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22140  predicted sugar kinase  55.74 
 
 
327 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218778  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2965  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.56 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.165365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2950  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.56 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2994  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.56 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120797  normal  0.388285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3508  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.22 
 
 
314 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0877111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14220  predicted sugar kinase  55.23 
 
 
362 aa  301  7.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4438  ATP-NAD/AcoX kinase  55.33 
 
 
297 aa  298  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0396483  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2356  ATP-NAD/AcoX kinase  53.82 
 
 
297 aa  298  7e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0719197  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3289  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.09 
 
 
306 aa  298  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903838  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11710  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.6 
 
 
307 aa  296  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0469837  normal  0.194229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3011  ATP-NAD/AcoX kinase  52.17 
 
 
344 aa  291  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1246  NAD(+) kinase  55.15 
 
 
296 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.641624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4073  ATP-NAD/AcoX kinase  48.68 
 
 
296 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1341  NAD(+) kinase  50.33 
 
 
343 aa  275  6e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1658  ATP-NAD/AcoX kinase  50.5 
 
 
290 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.059696  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2382  ATP-NAD/AcoX kinase  48.51 
 
 
295 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2827  ATP-NAD/AcoX kinase  43.88 
 
 
339 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236507  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13660  predicted sugar kinase  47.59 
 
 
314 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1125  NAD(+) kinase  50.66 
 
 
319 aa  259  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0680  NAD(+)/NADH kinase  48.73 
 
 
307 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0794  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  49.58 
 
 
340 aa  245  6e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0668234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0584  NAD(+) kinase  38.96 
 
 
268 aa  162  9e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  32.24 
 
 
283 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06550  ATP-NAD/AcoX kinase  36.44 
 
 
260 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000264989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  34.63 
 
 
288 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1509  NAD(+) kinase  37.78 
 
 
311 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1137  ATP-NAD/AcoX kinase  38.59 
 
 
271 aa  149  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  34.5 
 
 
285 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1692  ATP-NAD/AcoX kinase  32.3 
 
 
286 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.121225  hitchhiker  0.00242245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3486  ATP-NAD/AcoX kinase  36.2 
 
 
268 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00826859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  35.5 
 
 
290 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  32 
 
 
288 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0669  ATP-NAD/AcoX kinase  34.33 
 
 
294 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.935643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  36.1 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6912  ATP-NAD/AcoX kinase  37.27 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0629  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.56 
 
 
288 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.376086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  30.9 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  37.33 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  35.06 
 
 
290 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  33.02 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1040  ATP-NAD/AcoX kinase  35.57 
 
 
286 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831572  normal  0.0555439 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0816  NAD(+) kinase  32.16 
 
 
289 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  32.9 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.57 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0499  NAD(+) kinase  33.94 
 
 
279 aa  136  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01131  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.89 
 
 
294 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2738  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.07 
 
 
295 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004294  NAD kinase  31.56 
 
 
294 aa  135  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0775  ATP-NAD/AcoX kinase  34.51 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0146172  normal  0.735032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  35.78 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  33.89 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0731  NAD(+) kinase  34.31 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  34.31 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1479  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.44 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2876  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.72 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0398  ATP-NAD/AcoX kinase  36.74 
 
 
306 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.694587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  32.3 
 
 
288 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0964  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.73 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000412128  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1521  ATP-NAD/AcoX kinase  31.82 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0965149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2409  ATP-NAD/AcoX kinase  32.89 
 
 
287 aa  132  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1029  NAD(+) kinase  32.6 
 
 
283 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.501907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.57 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131242  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1046  NAD(+) kinase  31.91 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  32.3 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1693  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1898  ATP-NAD/AcoX kinase  29.01 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000307238  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1643  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.86 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000729399  hitchhiker  0.000860792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  33.48 
 
 
278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0718  NAD(+) kinase  33.83 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1617  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.4 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.771585  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  33.1 
 
 
309 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3217  NAD(+) kinase  29.05 
 
 
292 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1377  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.07 
 
 
293 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000779832  normal  0.0588551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2888  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.07 
 
 
293 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.4384500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2681  ATP-NAD/AcoX kinase  34.96 
 
 
285 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1465  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.4 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126818  hitchhiker  0.0000284944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1770  ATP-NAD/AcoX kinase  35.56 
 
 
282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0729  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.39 
 
 
298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0279623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.75 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1865  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.03 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.553553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.98 
 
 
296 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1391  ATP-NAD/AcoX kinase  32.42 
 
 
257 aa  129  8.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.209895  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01741  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  24.6 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>