More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0816 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0816  NAD(+) kinase  100 
 
 
289 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1898  ATP-NAD/AcoX kinase  50.52 
 
 
286 aa  301  7.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000307238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  43.31 
 
 
283 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1509  NAD(+) kinase  38.95 
 
 
311 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1692  ATP-NAD/AcoX kinase  38.52 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.121225  hitchhiker  0.00242245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  37.92 
 
 
288 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  40 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  34.28 
 
 
288 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  38.79 
 
 
302 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06550  ATP-NAD/AcoX kinase  39.45 
 
 
260 aa  195  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000264989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  36.84 
 
 
288 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  35.23 
 
 
285 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2681  ATP-NAD/AcoX kinase  40.52 
 
 
285 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  36.84 
 
 
288 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0900  ATP-NAD/AcoX kinase  36.52 
 
 
294 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000200756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2065  ATP-NAD kinase  39.23 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0428793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0941  ATP-NAD/AcoX kinase  40.68 
 
 
283 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  43.36 
 
 
278 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1029  NAD(+) kinase  39.57 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.501907  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1108  ATP-NAD/AcoX kinase  40.41 
 
 
280 aa  182  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1770  ATP-NAD/AcoX kinase  34.98 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  38.4 
 
 
290 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2071  NAD(+)/NADH kinase  35.44 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.323141  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  37.83 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  32.87 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1046  NAD(+) kinase  40.09 
 
 
285 aa  172  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.56 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1785  NAD(+)/NADH kinase  35.09 
 
 
276 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.422764  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.45 
 
 
292 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.62 
 
 
294 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  36.96 
 
 
293 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1391  ATP-NAD/AcoX kinase  39.46 
 
 
257 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.209895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1579  NAD(+) kinase  38.2 
 
 
288 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3480  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.89 
 
 
292 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0011597  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.89 
 
 
295 aa  168  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2792  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.69 
 
 
309 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000237572  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0657  NAD(+) kinase  32.5 
 
 
291 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  30.71 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0499  NAD(+) kinase  37.08 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2618  NAD(+) kinase  36.51 
 
 
292 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.01 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000370492  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0731  NAD(+) kinase  37.87 
 
 
272 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  36.96 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.56 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  38.3 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3331  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.68 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000815034  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2471  ATP-NAD/AcoX kinase  39.56 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.462719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3006  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.73 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000540691  hitchhiker  0.000000451072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0775  ATP-NAD/AcoX kinase  34.63 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0146172  normal  0.735032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1341  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.73 
 
 
309 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000175505  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.11 
 
 
296 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1378  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.73 
 
 
309 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1355  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.73 
 
 
309 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000052487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  37.87 
 
 
282 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1523  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.01 
 
 
292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  37.12 
 
 
309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4438  ATP-NAD/AcoX kinase  36.21 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0396483  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.57 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2573  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.13 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000341976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2072  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  34.36 
 
 
284 aa  162  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0915  NAD(+) kinase  36.04 
 
 
299 aa  162  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.895385  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1273  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.69 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000702127  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0650  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.93 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104906  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.67 
 
 
296 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.67 
 
 
296 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.67 
 
 
296 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01131  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.74 
 
 
294 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.67 
 
 
295 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000972456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.67 
 
 
315 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0064  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.82 
 
 
305 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000162022  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0066  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.82 
 
 
305 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.67 
 
 
296 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.67 
 
 
295 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000172182  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.67 
 
 
296 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1333  ATP-NAD/AcoX kinase  38.72 
 
 
261 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2163  ATP-NAD/AcoX kinase  33.33 
 
 
293 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0199773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.73 
 
 
309 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000296073  normal  0.942574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2806  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.73 
 
 
309 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126891  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3486  ATP-NAD/AcoX kinase  37.67 
 
 
268 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00826859  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2876  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.23 
 
 
295 aa  159  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0969  sugar kinase  30.5 
 
 
294 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.43035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  31.34 
 
 
290 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.73 
 
 
309 aa  159  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000229952  normal  0.0349698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4904  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.9 
 
 
306 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2738  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.23 
 
 
295 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  33.77 
 
 
292 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2170  ATP-NAD/AcoX kinase  29.56 
 
 
303 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00216575  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0867  NAD(+) kinase  34.48 
 
 
291 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2015  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.59 
 
 
305 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2438  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.73 
 
 
292 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.11 
 
 
300 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  31.67 
 
 
301 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004294  NAD kinase  34.98 
 
 
294 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2165  ATP-NAD/AcoX kinase  31.79 
 
 
285 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  34.74 
 
 
285 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1384  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.51 
 
 
299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0162292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  35.87 
 
 
295 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1302  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.43 
 
 
291 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.21 
 
 
302 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>