More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_25460  predicted sugar kinase  100 
 
 
306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5440  NAD(+) kinase  65.54 
 
 
300 aa  348  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2170  ATP-NAD/AcoX kinase  59.86 
 
 
303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00216575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  55.92 
 
 
301 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2481  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.53 
 
 
319 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2033  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.43 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1752  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.86 
 
 
295 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.000623558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6057  sugar kinase-like protein  55.3 
 
 
301 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3159  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.39 
 
 
299 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362338  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2012  ATP-NAD/AcoX kinase  57.48 
 
 
301 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1912  NAD(+) kinase  54.7 
 
 
308 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  54.7 
 
 
295 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4073  ATP-NAD/AcoX kinase  53.92 
 
 
296 aa  305  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3026  ATP-NAD/AcoX kinase  53.11 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.241982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2965  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.49 
 
 
307 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.165365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2950  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.49 
 
 
307 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2994  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.49 
 
 
307 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120797  normal  0.388285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3508  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.1 
 
 
314 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0877111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11710  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.13 
 
 
307 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0469837  normal  0.194229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3011  ATP-NAD/AcoX kinase  54.15 
 
 
344 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3148  ATP-NAD/AcoX kinase  52.46 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0248504  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3289  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.61 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903838  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.14 
 
 
340 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31092  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12380  predicted sugar kinase  51.53 
 
 
315 aa  280  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.497915  normal  0.271294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1246  NAD(+) kinase  53.22 
 
 
296 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.641624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4438  ATP-NAD/AcoX kinase  53.33 
 
 
297 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0396483  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1516  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.47 
 
 
346 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000349412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2827  ATP-NAD/AcoX kinase  47.55 
 
 
339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2356  ATP-NAD/AcoX kinase  59.05 
 
 
297 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0719197  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2382  ATP-NAD/AcoX kinase  48.99 
 
 
295 aa  259  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22140  predicted sugar kinase  48.65 
 
 
327 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218778  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1341  NAD(+) kinase  48.32 
 
 
343 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14220  predicted sugar kinase  47.42 
 
 
362 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0563897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13660  predicted sugar kinase  47.28 
 
 
314 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1658  ATP-NAD/AcoX kinase  52.74 
 
 
290 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.059696  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0794  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.75 
 
 
340 aa  227  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0668234  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0680  NAD(+)/NADH kinase  41.39 
 
 
307 aa  220  3e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1125  NAD(+) kinase  47.19 
 
 
319 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06550  ATP-NAD/AcoX kinase  37.78 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000264989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1509  NAD(+) kinase  38.66 
 
 
311 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1692  ATP-NAD/AcoX kinase  34.23 
 
 
286 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.121225  hitchhiker  0.00242245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  38.74 
 
 
288 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  35.91 
 
 
288 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  40.62 
 
 
288 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  36.86 
 
 
290 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  34.65 
 
 
285 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1046  NAD(+) kinase  37.09 
 
 
285 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2471  ATP-NAD/AcoX kinase  37.56 
 
 
316 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.462719 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  31.98 
 
 
283 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1029  NAD(+) kinase  36.67 
 
 
283 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.501907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2681  ATP-NAD/AcoX kinase  39.32 
 
 
285 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1137  ATP-NAD/AcoX kinase  38.72 
 
 
271 aa  142  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6912  ATP-NAD/AcoX kinase  36.14 
 
 
285 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0816  NAD(+) kinase  33.78 
 
 
289 aa  142  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1521  ATP-NAD/AcoX kinase  35.29 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0965149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1384  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.51 
 
 
299 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0162292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0584  NAD(+) kinase  30.58 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  35.78 
 
 
285 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1859  hypothetical protein  34.75 
 
 
290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  35.39 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  33.2 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0499  NAD(+) kinase  31.16 
 
 
279 aa  139  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0941  ATP-NAD/AcoX kinase  35.5 
 
 
283 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1770  ATP-NAD/AcoX kinase  36.68 
 
 
282 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  36.89 
 
 
292 aa  139  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3486  ATP-NAD/AcoX kinase  36.79 
 
 
268 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00826859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  35.39 
 
 
288 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1445  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.1 
 
 
299 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00237626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1898  ATP-NAD/AcoX kinase  33.49 
 
 
286 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000307238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.33 
 
 
295 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  32.76 
 
 
303 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2065  ATP-NAD kinase  36.71 
 
 
284 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0428793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  37.44 
 
 
290 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0718  NAD(+) kinase  36.62 
 
 
283 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0932  ATP-NAD/AcoX kinase  34.59 
 
 
278 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00571594  normal  0.539204 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  33.82 
 
 
301 aa  135  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4289  ATP-NAD/AcoX kinase  34.25 
 
 
278 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176286  normal  0.0142218 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  32.86 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  35.2 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2808  ATP-NAD/AcoX kinase  37.04 
 
 
288 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.48 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1108  ATP-NAD/AcoX kinase  33.99 
 
 
280 aa  132  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1040  ATP-NAD/AcoX kinase  34.15 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831572  normal  0.0555439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.48 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.48 
 
 
296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.48 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0019  putative NAD+ kinase  36.57 
 
 
286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1579  NAD(+) kinase  37.88 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.48 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.33 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2050  NAD(+) kinase  32.56 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2409  ATP-NAD/AcoX kinase  33.33 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1693  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.22 
 
 
294 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1276  NAD(+) kinase  31.93 
 
 
299 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.71 
 
 
296 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.28 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2191  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.4 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.94 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000972456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.94 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000172182  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2876  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.33 
 
 
295 aa  128  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>