More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1525 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  100 
 
 
290 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3408  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.26 
 
 
292 aa  205  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  39.71 
 
 
302 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  39.93 
 
 
288 aa  201  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04330  ATP-NAD kinase  34.14 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  39.19 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0941  ATP-NAD/AcoX kinase  42.12 
 
 
283 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1693  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.26 
 
 
294 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.92 
 
 
293 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  36.59 
 
 
288 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  38.54 
 
 
292 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2065  ATP-NAD kinase  38.97 
 
 
284 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0428793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1049  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.2 
 
 
295 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0798943  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0629  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.23 
 
 
288 aa  186  6e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.376086 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0669  ATP-NAD/AcoX kinase  39.22 
 
 
294 aa  185  9e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.935643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1509  NAD(+) kinase  36.43 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3891  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.56 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  34.38 
 
 
285 aa  182  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0658  ATP-NAD/AcoX kinase  39.15 
 
 
291 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.56 
 
 
318 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  37.28 
 
 
285 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  34.95 
 
 
288 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06550  ATP-NAD/AcoX kinase  38.58 
 
 
260 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000264989  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2165  ATP-NAD/AcoX kinase  36.68 
 
 
285 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  39.26 
 
 
278 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0657  NAD(+) kinase  35.09 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3488  NAD(+)/NADH kinase family protein  38.38 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000826356 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.79 
 
 
300 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.79 
 
 
345 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.79 
 
 
345 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  38.11 
 
 
302 aa  178  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.66 
 
 
299 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.76 
 
 
312 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  38.11 
 
 
312 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.44 
 
 
300 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.56 
 
 
344 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.56 
 
 
320 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1046  NAD(+) kinase  34.72 
 
 
285 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.44 
 
 
300 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4438  ATP-NAD/AcoX kinase  36.17 
 
 
297 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0396483  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  34.39 
 
 
283 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2050  NAD(+) kinase  34.48 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  34.6 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1643  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.17 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000729399  hitchhiker  0.000860792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3334  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.02 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.74 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0908  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.27 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.42987  normal  0.404915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  39.06 
 
 
309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.74 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.97 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2681  ATP-NAD/AcoX kinase  39.49 
 
 
285 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2640  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.74 
 
 
300 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42258  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  37.68 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1617  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.91 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.771585  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.09 
 
 
300 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.09 
 
 
300 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  35.27 
 
 
303 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  38.63 
 
 
301 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  36.86 
 
 
284 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3217  NAD(+) kinase  34.38 
 
 
292 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159038  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  38.02 
 
 
301 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1302  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.8 
 
 
291 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0260  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.44 
 
 
300 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0744  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.44 
 
 
300 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.09 
 
 
300 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1465  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.14 
 
 
339 aa  169  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126818  hitchhiker  0.0000284944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  38.03 
 
 
290 aa  169  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0718  NAD(+) kinase  39.62 
 
 
283 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0964  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.03 
 
 
298 aa  168  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000412128  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.08 
 
 
297 aa  168  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2409  ATP-NAD/AcoX kinase  34.03 
 
 
287 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0729  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.38 
 
 
298 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0279623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.99 
 
 
293 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  37.99 
 
 
285 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2792  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.95 
 
 
309 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000237572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1579  NAD(+) kinase  37.73 
 
 
288 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1692  ATP-NAD/AcoX kinase  31.82 
 
 
286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.121225  hitchhiker  0.00242245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3297  ATP-NAD/AcoX kinase  34.38 
 
 
292 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0523073  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.6 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3095  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.33 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0775  ATP-NAD/AcoX kinase  41.23 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0146172  normal  0.735032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2806  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.15 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126891  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  40.34 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1051  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.69 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2876  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.54 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  40.34 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1341  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.64 
 
 
309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000175505  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.29 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000296073  normal  0.942574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.81 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000229952  normal  0.0349698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1378  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.64 
 
 
309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1355  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.64 
 
 
309 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000052487  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  39.48 
 
 
290 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3006  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.64 
 
 
292 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000540691  hitchhiker  0.000000451072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2808  ATP-NAD/AcoX kinase  34.95 
 
 
288 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1651  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.06 
 
 
298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105713  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3148  ATP-NAD/AcoX kinase  38.19 
 
 
312 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0248504  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1273  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.99 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000702127  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1523  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.95 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0611  ATP-dependent NAD kinase  33.21 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2738  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.18 
 
 
295 aa  161  9e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>