More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3488 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3488  NAD(+)/NADH kinase family protein  100 
 
 
306 aa  620  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000826356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3334  NAD(+)/NADH kinase family protein  67 
 
 
301 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1302  NAD(+)/NADH kinase family protein  64.71 
 
 
291 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0908  NAD(+)/NADH kinase family protein  66.78 
 
 
291 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.42987  normal  0.404915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1651  NAD(+)/NADH kinase family protein  61.82 
 
 
298 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1051  NAD(+)/NADH kinase family protein  61.49 
 
 
298 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  60.62 
 
 
298 aa  363  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  60.27 
 
 
298 aa  360  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3601  NAD(+)/NADH kinase family protein  60.47 
 
 
298 aa  358  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5420  NAD(+)/NADH kinase family protein  57.43 
 
 
298 aa  355  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4336  NAD(+)/NADH kinase family protein  57.81 
 
 
303 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.92 
 
 
318 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  58.39 
 
 
302 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  57.84 
 
 
312 aa  331  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.74 
 
 
345 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.74 
 
 
345 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.82 
 
 
300 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  57.49 
 
 
312 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  56.29 
 
 
300 aa  328  9e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.41 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.41 
 
 
320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  56.49 
 
 
299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.24 
 
 
300 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  56.14 
 
 
300 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  56.29 
 
 
300 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.79 
 
 
300 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.79 
 
 
300 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2640  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.17 
 
 
300 aa  322  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42258  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.79 
 
 
300 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.79 
 
 
300 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.79 
 
 
300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0260  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.79 
 
 
300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0744  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.79 
 
 
300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0999  NAD(+)/NADH kinase family protein  58.45 
 
 
313 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.893596  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  53.17 
 
 
301 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  52.46 
 
 
301 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  44.95 
 
 
309 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  43.55 
 
 
290 aa  256  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  44.37 
 
 
290 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  45.14 
 
 
293 aa  248  9e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2422  NAD(+)/NADH kinase family protein  45.64 
 
 
294 aa  239  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2072  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.51 
 
 
294 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1378  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.79 
 
 
309 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1341  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.79 
 
 
309 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000175505  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1355  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.44 
 
 
309 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000052487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2792  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.96 
 
 
309 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000237572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3006  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.44 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000540691  hitchhiker  0.000000451072 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2806  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.44 
 
 
309 aa  225  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126891  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.44 
 
 
309 aa  225  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000229952  normal  0.0349698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1523  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.1 
 
 
292 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.44 
 
 
309 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000296073  normal  0.942574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1273  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.4 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000702127  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.16 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.94 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000370492  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2438  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.06 
 
 
292 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3480  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.6 
 
 
292 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0011597  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.64 
 
 
292 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131242  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.46 
 
 
296 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1859  hypothetical protein  44.14 
 
 
290 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2573  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.71 
 
 
309 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000341976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.97 
 
 
295 aa  215  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.69 
 
 
295 aa  215  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.85 
 
 
295 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000172182  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.85 
 
 
295 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000972456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3331  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.41 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000815034  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.77 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.77 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.77 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.75 
 
 
296 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1617  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.31 
 
 
340 aa  210  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.771585  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.75 
 
 
296 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02268  NAD kinase  39.08 
 
 
291 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.05 
 
 
296 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0964  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.6 
 
 
298 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000412128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0729  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.6 
 
 
298 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0279623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1384  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.93 
 
 
299 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0162292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2163  ATP-NAD/AcoX kinase  36.52 
 
 
293 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0199773 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  40 
 
 
295 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  40 
 
 
300 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1643  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.97 
 
 
339 aa  206  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000729399  hitchhiker  0.000860792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1465  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.62 
 
 
339 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126818  hitchhiker  0.0000284944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3217  NAD(+) kinase  39.85 
 
 
292 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1445  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.58 
 
 
299 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00237626  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1715  NAD(+) kinase  40.14 
 
 
291 aa  201  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2876  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.9 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  42.64 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2738  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.9 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0915  NAD(+) kinase  38.25 
 
 
299 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.895385  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.75 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000258302  normal  0.101663 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1377  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.24 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000779832  normal  0.0588551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2888  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.24 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.4384500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.98 
 
 
294 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004294  NAD kinase  41.61 
 
 
294 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3297  ATP-NAD/AcoX kinase  39.47 
 
 
292 aa  199  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0523073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  43.46 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0611  ATP-dependent NAD kinase  36 
 
 
301 aa  197  3e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3824  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.76 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.24 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  39.31 
 
 
292 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1190  NAD(+) kinase  37.85 
 
 
293 aa  195  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>