More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2065 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2065  ATP-NAD kinase  100 
 
 
284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0428793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0941  ATP-NAD/AcoX kinase  80.28 
 
 
283 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  71.48 
 
 
302 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  69.66 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  68.28 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2681  ATP-NAD/AcoX kinase  64.91 
 
 
285 aa  374  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1579  NAD(+) kinase  58.8 
 
 
288 aa  332  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  55.09 
 
 
285 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  45.64 
 
 
303 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0775  ATP-NAD/AcoX kinase  55.22 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0146172  normal  0.735032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1046  NAD(+) kinase  43.16 
 
 
285 aa  248  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0718  NAD(+) kinase  49.47 
 
 
283 aa  247  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1108  ATP-NAD/AcoX kinase  44.29 
 
 
280 aa  246  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  45.77 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0731  NAD(+) kinase  45.8 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  44.76 
 
 
282 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  44.41 
 
 
282 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1509  NAD(+) kinase  43.62 
 
 
311 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  43.36 
 
 
288 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1692  ATP-NAD/AcoX kinase  39.65 
 
 
286 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.121225  hitchhiker  0.00242245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  39.1 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  38.57 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  39.44 
 
 
290 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2471  ATP-NAD/AcoX kinase  40 
 
 
316 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.462719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  37.85 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  40.14 
 
 
293 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.07 
 
 
293 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  41.76 
 
 
288 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06550  ATP-NAD/AcoX kinase  41.31 
 
 
260 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000264989  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0499  NAD(+) kinase  40.75 
 
 
279 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.91 
 
 
295 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0900  ATP-NAD/AcoX kinase  39.65 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000200756  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0650  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.28 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  39.02 
 
 
285 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.91 
 
 
315 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.91 
 
 
296 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.91 
 
 
296 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.91 
 
 
296 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1859  hypothetical protein  37.98 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.79 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1770  ATP-NAD/AcoX kinase  38.57 
 
 
282 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.19 
 
 
312 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1302  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.49 
 
 
291 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  36.4 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.19 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0581  ATP-NAD/AcoX kinase  40.85 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1523  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.76 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.79 
 
 
300 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2640  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.44 
 
 
300 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42258  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.91 
 
 
295 aa  195  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.82 
 
 
300 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.89 
 
 
296 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2792  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.72 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000237572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.82 
 
 
345 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.89 
 
 
318 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.82 
 
 
345 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.55 
 
 
292 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131242  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.11 
 
 
309 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000296073  normal  0.942574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2806  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.11 
 
 
309 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126891  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  36.86 
 
 
292 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.76 
 
 
309 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000229952  normal  0.0349698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  42.86 
 
 
288 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.49 
 
 
302 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.82 
 
 
299 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.11 
 
 
300 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.44 
 
 
296 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1378  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.04 
 
 
309 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.44 
 
 
296 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1341  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.04 
 
 
309 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000175505  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1355  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.04 
 
 
309 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000052487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004294  NAD kinase  34.47 
 
 
294 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3006  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.66 
 
 
292 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000540691  hitchhiker  0.000000451072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3217  NAD(+) kinase  36.62 
 
 
292 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159038  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0915  NAD(+) kinase  34.72 
 
 
299 aa  192  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.895385  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  37.14 
 
 
285 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0908  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.79 
 
 
291 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.42987  normal  0.404915 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.46 
 
 
300 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2438  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.17 
 
 
292 aa  192  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.46 
 
 
300 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.09 
 
 
344 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0964  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.04 
 
 
298 aa  191  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000412128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1377  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.04 
 
 
293 aa  191  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000779832  normal  0.0588551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2888  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.04 
 
 
293 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.4384500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.46 
 
 
320 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.39 
 
 
300 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0729  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.69 
 
 
298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0279623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0816  NAD(+) kinase  39.23 
 
 
289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0611  ATP-dependent NAD kinase  33.57 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0260  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.04 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0744  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.04 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.39 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.74 
 
 
300 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.74 
 
 
300 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2050  NAD(+) kinase  38.57 
 
 
285 aa  189  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  38.97 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.3 
 
 
295 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000972456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.3 
 
 
295 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000172182  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.42 
 
 
292 aa  188  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000258302  normal  0.101663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1273  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.62 
 
 
309 aa  188  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000702127  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2573  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.97 
 
 
309 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000341976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>