More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3237 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  93.05 
 
 
259 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  88.72 
 
 
274 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  85.27 
 
 
259 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.88 
 
 
259 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  79.84 
 
 
261 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  81.4 
 
 
259 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  64.4 
 
 
255 aa  320  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  62.4 
 
 
288 aa  315  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  61.96 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  61.26 
 
 
263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  61.96 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  61.96 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  61.66 
 
 
256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  60.47 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  59.36 
 
 
263 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  61.42 
 
 
255 aa  298  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.73 
 
 
257 aa  297  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.08 
 
 
274 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.26 
 
 
257 aa  287  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.05 
 
 
257 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.69 
 
 
257 aa  282  5.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  56.22 
 
 
253 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.23 
 
 
251 aa  279  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.31 
 
 
255 aa  275  8e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.77 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.87 
 
 
258 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.72 
 
 
257 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.2 
 
 
269 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  56.41 
 
 
267 aa  265  5.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.32 
 
 
265 aa  261  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.32 
 
 
265 aa  261  6.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.83 
 
 
254 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  58.8 
 
 
233 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.22 
 
 
249 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.98 
 
 
257 aa  258  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.59 
 
 
256 aa  258  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.22 
 
 
254 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.22 
 
 
254 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.36 
 
 
255 aa  249  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.78 
 
 
257 aa  247  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.58 
 
 
256 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.79 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.84 
 
 
261 aa  236  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.51 
 
 
263 aa  230  2e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.56 
 
 
209 aa  228  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.08 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.54 
 
 
264 aa  194  1e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  33.86 
 
 
253 aa  149  4e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0744  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.78 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.638835  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1358  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.78 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.63625  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0669  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.78 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2628  ATP-NAD/AcoX kinase  28.51 
 
 
289 aa  85.5  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0843038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.2 
 
 
293 aa  85.5  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_002950  PG0629  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.95 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.376086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  34.44 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  33.14 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
300 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1028  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.38 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.16 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0853  NAD(+) kinase  30.96 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000499611  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1092  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.38 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.886083  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  32.26 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.16 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  29.72 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  32.82 
 
 
288 aa  79  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0353  ATP-NAD/AcoX kinase  28 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  36.43 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  36.05 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  36.43 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  31.17 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0877  ATP-NAD/AcoX kinase  28.23 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.16 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1702  NAD(+) kinase  32.41 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  30.63 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.17 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.17 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1094  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.61 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.06039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1700  NAD(+) kinase  31.76 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580359  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  33 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  31.37 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.66 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1049  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.89 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0798943  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3488  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.58 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000826356 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0297  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  25.65 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  34.84 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0650  conserved hypothetical protein, putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.76 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.332208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2481  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.1 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6912  ATP-NAD/AcoX kinase  34.66 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1495  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.57 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  35.06 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1276  NAD(+) kinase  36.13 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  32.67 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0581  ATP-NAD/AcoX kinase  36.54 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3334  NAD(+)/NADH kinase family protein  29.06 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  34.19 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>