More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1804 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  477  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  74.25 
 
 
257 aa  360  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  72.53 
 
 
257 aa  357  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  70.74 
 
 
257 aa  323  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  62.34 
 
 
257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  67.84 
 
 
258 aa  299  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  64.04 
 
 
263 aa  299  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  62.07 
 
 
261 aa  293  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  66.23 
 
 
257 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  64.5 
 
 
265 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  64.5 
 
 
265 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  59.39 
 
 
255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  60.53 
 
 
263 aa  281  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.23 
 
 
259 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  58.87 
 
 
253 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.74 
 
 
274 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.8 
 
 
259 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.91 
 
 
259 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  59.91 
 
 
288 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.8 
 
 
259 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.21 
 
 
259 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.19 
 
 
274 aa  267  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.46 
 
 
255 aa  265  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  57.33 
 
 
255 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  54.55 
 
 
267 aa  256  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  55.13 
 
 
256 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  55.13 
 
 
256 aa  256  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.58 
 
 
269 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.59 
 
 
251 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.39 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  54.74 
 
 
256 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  54.27 
 
 
256 aa  252  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.95 
 
 
249 aa  251  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.45 
 
 
257 aa  247  9e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  53.02 
 
 
256 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.07 
 
 
255 aa  241  6e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.16 
 
 
256 aa  241  9e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.51 
 
 
254 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.68 
 
 
254 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.68 
 
 
254 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.66 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.43 
 
 
258 aa  230  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.43 
 
 
257 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.45 
 
 
209 aa  228  7e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.88 
 
 
261 aa  228  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.69 
 
 
263 aa  203  2e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.24 
 
 
263 aa  194  7e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.29 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  34.38 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  37.75 
 
 
287 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0877  ATP-NAD/AcoX kinase  27.9 
 
 
261 aa  88.6  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  34.64 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.33 
 
 
300 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.04 
 
 
302 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1700  NAD(+) kinase  34.44 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580359  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.5 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  31.46 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.18 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.18 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.18 
 
 
300 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2370  ATP-NAD/AcoX kinase  34.69 
 
 
283 aa  82  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.18 
 
 
293 aa  82  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  31.72 
 
 
285 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1238  NAD(+) kinase  32.13 
 
 
312 aa  81.6  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0744  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.11 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.638835  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0669  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.11 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1358  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.58 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.63625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.03 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.44 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  36.84 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.68 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.68 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.53 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.68 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.68 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0629  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.04 
 
 
288 aa  79  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.376086 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0924  ATP-NAD/AcoX kinase  36.69 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000123644  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1702  NAD(+) kinase  34.67 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  34.21 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.74 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.74 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.74 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2501  ATP-NAD/AcoX kinase  32.22 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.439841  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.5 
 
 
300 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1454  NAD(+) kinase  36.88 
 
 
273 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0456787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4336  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.7 
 
 
303 aa  79  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.13 
 
 
297 aa  78.6  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1284  ATP-NAD/AcoX kinase  37.5 
 
 
289 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0066  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.28 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0064  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.28 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000162022  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.61 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1495  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.13 
 
 
302 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35817  predicted protein  30.41 
 
 
314 aa  77  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.322999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5420  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.67 
 
 
298 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.74 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2471  ATP-NAD/AcoX kinase  36.08 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.462719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0260  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.74 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0744  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.74 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.17 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2015  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.69 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>