More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6083 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  100 
 
 
256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  95.7 
 
 
256 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  76.56 
 
 
256 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  76.95 
 
 
256 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  75.78 
 
 
256 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  74.31 
 
 
255 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  65.35 
 
 
263 aa  329  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  61.81 
 
 
263 aa  319  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  62.45 
 
 
259 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  63.78 
 
 
259 aa  305  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.81 
 
 
261 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.35 
 
 
274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.66 
 
 
259 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.71 
 
 
259 aa  296  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  57.54 
 
 
255 aa  295  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  59.29 
 
 
288 aa  288  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.66 
 
 
259 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.77 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.16 
 
 
257 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.55 
 
 
257 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.52 
 
 
257 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  54.18 
 
 
253 aa  261  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.47 
 
 
257 aa  258  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.18 
 
 
269 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.01 
 
 
251 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.2 
 
 
255 aa  255  6e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.66 
 
 
265 aa  254  7e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.66 
 
 
265 aa  254  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.61 
 
 
249 aa  254  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50 
 
 
257 aa  249  3e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.65 
 
 
258 aa  247  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  52.32 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.61 
 
 
255 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.2 
 
 
257 aa  241  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  54.74 
 
 
233 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.4 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.04 
 
 
209 aa  232  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.6 
 
 
256 aa  229  4e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.43 
 
 
261 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  49.6 
 
 
254 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.8 
 
 
254 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.8 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.22 
 
 
256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  46.8 
 
 
257 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  46.43 
 
 
258 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.15 
 
 
263 aa  218  7.999999999999999e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.62 
 
 
263 aa  207  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.58 
 
 
264 aa  190  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  35.46 
 
 
253 aa  157  1e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1094  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.79 
 
 
278 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.06039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1040  ATP-NAD/AcoX kinase  36.72 
 
 
286 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831572  normal  0.0555439 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  36.18 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.95 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  30.43 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  32.93 
 
 
287 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1238  NAD(+) kinase  37.23 
 
 
312 aa  82  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1284  ATP-NAD/AcoX kinase  38.16 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1700  NAD(+) kinase  31.63 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580359  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.16 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2628  ATP-NAD/AcoX kinase  28.04 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0843038  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1454  NAD(+) kinase  37.91 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0456787  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1785  NAD(+)/NADH kinase  31.18 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.422764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2071  NAD(+)/NADH kinase  31.18 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.323141  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0877  ATP-NAD/AcoX kinase  31.5 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  26.39 
 
 
283 aa  79  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.64 
 
 
312 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1702  NAD(+) kinase  33.18 
 
 
309 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2191  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.7 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0718  NAD(+) kinase  31.28 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1358  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.86 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.63625  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0680  NAD(+)/NADH kinase  33.33 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  38.13 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.67 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0669  ATP-NAD/AcoX kinase  29.74 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.935643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  38.13 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.67 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1341  NAD(+) kinase  37.82 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2356  ATP-NAD/AcoX kinase  35.1 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0719197  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2170  ATP-NAD/AcoX kinase  34.42 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00216575  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1185  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.65 
 
 
566 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.303831  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0853  NAD(+) kinase  34.57 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000499611  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0794  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.8 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0668234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0744  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.29 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.638835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  37.01 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0840  NAD(+) kinase  33.17 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.947583  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0669  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.29 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2481  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.71 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  28.74 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.45 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  37.34 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1391  ATP-NAD/AcoX kinase  34.34 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.209895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.98 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04760  NADH kinase, putative  32.64 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87580  NAD kinase associated with ferric reductase  30.48 
 
 
575 aa  75.1  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  33 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3486  ATP-NAD/AcoX kinase  32.3 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00826859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0019  putative NAD+ kinase  31.67 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6057  sugar kinase-like protein  33.52 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.58 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  34.32 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>