More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0822 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  72.69 
 
 
255 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  72.91 
 
 
254 aa  353  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  72.91 
 
 
254 aa  353  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  72.91 
 
 
254 aa  353  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  69.48 
 
 
251 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  68.8 
 
 
249 aa  341  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  62.15 
 
 
255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.45 
 
 
274 aa  285  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  57.2 
 
 
253 aa  284  9e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.24 
 
 
259 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  57.77 
 
 
288 aa  278  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.2 
 
 
274 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.27 
 
 
269 aa  277  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56 
 
 
257 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.4 
 
 
257 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  57.6 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.8 
 
 
261 aa  271  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.82 
 
 
257 aa  267  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.77 
 
 
259 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.22 
 
 
255 aa  266  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  55.6 
 
 
255 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.52 
 
 
259 aa  265  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.82 
 
 
256 aa  265  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.6 
 
 
259 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.39 
 
 
257 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.17 
 
 
259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  53.36 
 
 
267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  54.22 
 
 
256 aa  258  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  54.22 
 
 
256 aa  257  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.5 
 
 
257 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  53.82 
 
 
256 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.24 
 
 
257 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.78 
 
 
261 aa  256  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.24 
 
 
258 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  53.2 
 
 
256 aa  255  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.18 
 
 
258 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.28 
 
 
265 aa  252  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.28 
 
 
265 aa  252  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  57.46 
 
 
233 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  52.8 
 
 
263 aa  248  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  50.8 
 
 
256 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  49.21 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.89 
 
 
209 aa  225  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.81 
 
 
256 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  46.15 
 
 
263 aa  223  3e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.34 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.08 
 
 
264 aa  181  8.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  36 
 
 
253 aa  154  9e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1238  NAD(+) kinase  35.84 
 
 
312 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  41.61 
 
 
300 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  37.25 
 
 
301 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  41.1 
 
 
302 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  40 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  40 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  42.34 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  40 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.73 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1700  NAD(+) kinase  33.7 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580359  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  40.15 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.73 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  42.34 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0260  NAD(+)/NADH kinase family protein  42.34 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0744  NAD(+)/NADH kinase family protein  42.34 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.38 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.38 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2640  NAD(+)/NADH kinase family protein  42.34 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42258  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.38 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.38 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5420  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.86 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  40.88 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  41.61 
 
 
300 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  41.61 
 
 
300 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  35.29 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  35.29 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2481  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.06 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  39.13 
 
 
318 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  40.88 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  35.26 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.31 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  31.71 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6912  ATP-NAD/AcoX kinase  36.9 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.68 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.68 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1702  NAD(+) kinase  31.61 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1051  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.23 
 
 
298 aa  75.1  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1040  ATP-NAD/AcoX kinase  38.57 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831572  normal  0.0555439 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  34.3 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  36.76 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1651  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.97 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  32.12 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1579  NAD(+) kinase  28.37 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0629  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.2 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.376086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1912  NAD(+) kinase  32.28 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0840  NAD(+) kinase  32.8 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.947583  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3601  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.97 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672502 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2628  ATP-NAD/AcoX kinase  23.75 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0843038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0969  sugar kinase  33.78 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.43035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  31.21 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  30.46 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>