More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1702 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1702  NAD(+) kinase  100 
 
 
309 aa  607  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1700  NAD(+) kinase  92.88 
 
 
309 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580359  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1238  NAD(+) kinase  52.49 
 
 
312 aa  265  8e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1040  ATP-NAD/AcoX kinase  43.22 
 
 
286 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831572  normal  0.0555439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6912  ATP-NAD/AcoX kinase  41.18 
 
 
285 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1137  ATP-NAD/AcoX kinase  38.46 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  33.85 
 
 
283 aa  132  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  29.71 
 
 
288 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1333  ATP-NAD/AcoX kinase  34.56 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0657  NAD(+) kinase  34.88 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  34.2 
 
 
292 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3486  ATP-NAD/AcoX kinase  36.33 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00826859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2071  NAD(+)/NADH kinase  27.78 
 
 
276 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.323141  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1785  NAD(+)/NADH kinase  27.41 
 
 
276 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.422764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0816  NAD(+) kinase  36.92 
 
 
289 aa  122  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  28.42 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  37.07 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0499  NAD(+) kinase  34.74 
 
 
279 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2409  ATP-NAD/AcoX kinase  30.95 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.44 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1692  ATP-NAD/AcoX kinase  27.76 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.121225  hitchhiker  0.00242245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0853  NAD(+) kinase  32.9 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000499611  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2808  ATP-NAD/AcoX kinase  32.65 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2050  NAD(+) kinase  28.22 
 
 
285 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2165  ATP-NAD/AcoX kinase  28.04 
 
 
285 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04330  ATP-NAD kinase  27.02 
 
 
294 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.76 
 
 
297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  34.57 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.46 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  31.09 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  30.94 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06550  ATP-NAD/AcoX kinase  35.42 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000264989  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.91 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3508  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.48 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0877111 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  32.84 
 
 
262 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  37.36 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  32.14 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.81 
 
 
302 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  27.92 
 
 
285 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2618  NAD(+) kinase  35.56 
 
 
292 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2965  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.04 
 
 
307 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.165365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2950  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.04 
 
 
307 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2994  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.04 
 
 
307 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120797  normal  0.388285 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2876  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.93 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2738  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.93 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4438  ATP-NAD/AcoX kinase  34.39 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0396483  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2471  ATP-NAD/AcoX kinase  30.26 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.462719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0260  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.62 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0744  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.62 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3289  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.91 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903838  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2827  ATP-NAD/AcoX kinase  33.62 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02503  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.07 
 
 
292 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000896223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1060  ATP-NAD/AcoX kinase  28.07 
 
 
292 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000577429  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1029  NAD(+) kinase  34.88 
 
 
283 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.501907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2899  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.07 
 
 
292 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060122  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02467  hypothetical protein  28.07 
 
 
292 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000137745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1509  NAD(+) kinase  32.31 
 
 
311 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  34.74 
 
 
301 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3004  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.07 
 
 
292 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1069  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.07 
 
 
292 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0224782  normal  0.0704222 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.19 
 
 
300 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2370  ATP-NAD/AcoX kinase  34.02 
 
 
283 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.07 
 
 
292 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000144313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3855  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.07 
 
 
292 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000447787  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.19 
 
 
300 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.19 
 
 
300 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.07 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000128996  normal  0.109172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.76 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2640  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.19 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42258  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.8 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000972456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.8 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000172182  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3026  ATP-NAD/AcoX kinase  32.57 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.241982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.76 
 
 
300 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1276  NAD(+) kinase  34.45 
 
 
299 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0019  putative NAD+ kinase  30.57 
 
 
286 aa  109  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.77 
 
 
295 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1046  NAD(+) kinase  31.33 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2878  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.97 
 
 
292 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.126338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0867  NAD(+) kinase  30.96 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2827  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.72 
 
 
292 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000328242  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2898  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.72 
 
 
292 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0669  ATP-NAD/AcoX kinase  30.41 
 
 
294 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.935643  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3009  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.72 
 
 
292 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2896  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.72 
 
 
292 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.72588  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0840  NAD(+) kinase  34.76 
 
 
271 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.947583  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  32.29 
 
 
303 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3334  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.07 
 
 
301 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3095  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.77 
 
 
292 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  32.61 
 
 
309 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2191  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.27 
 
 
275 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.47 
 
 
300 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0584  NAD(+) kinase  34.83 
 
 
268 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  29.73 
 
 
288 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.19 
 
 
296 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0941  ATP-NAD/AcoX kinase  32.74 
 
 
283 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  29.01 
 
 
288 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2072  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.76 
 
 
294 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.19 
 
 
296 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1246  NAD(+) kinase  32.59 
 
 
296 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.641624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.51 
 
 
296 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>