More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1578 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  69.48 
 
 
255 aa  343  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  69.48 
 
 
255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  70.28 
 
 
254 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  70.28 
 
 
254 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  70.28 
 
 
254 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  63.2 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  60.24 
 
 
255 aa  306  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60 
 
 
274 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.84 
 
 
269 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  59.04 
 
 
288 aa  288  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.04 
 
 
259 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.23 
 
 
274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.63 
 
 
261 aa  278  5e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.43 
 
 
259 aa  278  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  57.43 
 
 
256 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  57.43 
 
 
256 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  57.03 
 
 
256 aa  275  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.23 
 
 
259 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.22 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  54.4 
 
 
253 aa  271  9e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.63 
 
 
259 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.83 
 
 
259 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  56.63 
 
 
255 aa  268  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  55.02 
 
 
263 aa  263  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.18 
 
 
255 aa  258  7e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.78 
 
 
256 aa  257  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.99 
 
 
258 aa  257  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.22 
 
 
257 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  53.01 
 
 
256 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  52.61 
 
 
256 aa  255  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  53.82 
 
 
263 aa  255  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.81 
 
 
257 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.21 
 
 
257 aa  254  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.24 
 
 
258 aa  251  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.88 
 
 
257 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  51.72 
 
 
267 aa  248  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.4 
 
 
257 aa  243  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.25 
 
 
265 aa  242  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.25 
 
 
265 aa  242  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  54.59 
 
 
233 aa  241  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.2 
 
 
256 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  49.8 
 
 
257 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.12 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.22 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.59 
 
 
209 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.19 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.21 
 
 
264 aa  191  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  35.46 
 
 
253 aa  161  1e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1238  NAD(+) kinase  36.44 
 
 
312 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  38.51 
 
 
287 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2481  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.76 
 
 
319 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11710  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.73 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0469837  normal  0.194229 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0680  NAD(+)/NADH kinase  32.49 
 
 
307 aa  82  0.000000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0353  ATP-NAD/AcoX kinase  27.49 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  37.86 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  37.86 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  31.15 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1700  NAD(+) kinase  36 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580359  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  33.01 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  33.74 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.39 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.54 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.01 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  33.33 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  34.3 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2965  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.62 
 
 
307 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.165365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2950  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.62 
 
 
307 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2994  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.62 
 
 
307 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120797  normal  0.388285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3289  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.32 
 
 
306 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903838  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1276  NAD(+) kinase  38.82 
 
 
299 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2370  ATP-NAD/AcoX kinase  31.33 
 
 
283 aa  79  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1702  NAD(+) kinase  36.42 
 
 
309 aa  79  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1912  NAD(+) kinase  33.75 
 
 
308 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.06 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.14 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.23 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0744  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.15 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.638835  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0669  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.15 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.23 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.23 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2371  ATP-NAD/AcoX kinase  32.7 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1029  NAD(+) kinase  31.02 
 
 
283 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.501907  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1358  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.15 
 
 
286 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.63625  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.23 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0835  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.91 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1752  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.69 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.000623558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1040  ATP-NAD/AcoX kinase  36.52 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831572  normal  0.0555439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3508  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.81 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0877111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.43 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.51 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0428  hypothetical protein  36.31 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.51 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3334  NAD(+)/NADH kinase family protein  29.91 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1465  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.97 
 
 
339 aa  75.5  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126818  hitchhiker  0.0000284944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6912  ATP-NAD/AcoX kinase  40.29 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16881  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.75 
 
 
320 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.75 
 
 
300 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  30.15 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>