More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5177 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  84.94 
 
 
259 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.24 
 
 
259 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.54 
 
 
274 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  80.31 
 
 
261 aa  421  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  81.4 
 
 
259 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  81.01 
 
 
259 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  63.78 
 
 
255 aa  324  9e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  63.92 
 
 
256 aa  322  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  63.92 
 
 
256 aa  321  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  63.92 
 
 
256 aa  321  8e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  61.18 
 
 
263 aa  315  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  63.78 
 
 
256 aa  314  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  62.99 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  62.11 
 
 
288 aa  308  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  63.05 
 
 
274 aa  307  9e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  63.24 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  58.43 
 
 
263 aa  295  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.71 
 
 
257 aa  294  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.73 
 
 
257 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.13 
 
 
257 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  57.03 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.83 
 
 
251 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.6 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  58.37 
 
 
267 aa  271  7e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.76 
 
 
257 aa  271  8.000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.2 
 
 
258 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.24 
 
 
255 aa  258  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58 
 
 
269 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.22 
 
 
249 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.91 
 
 
257 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.4 
 
 
254 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  59.47 
 
 
233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.17 
 
 
257 aa  251  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.45 
 
 
265 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.45 
 
 
265 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.78 
 
 
256 aa  247  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54 
 
 
254 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54 
 
 
254 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  49.43 
 
 
261 aa  241  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.58 
 
 
258 aa  239  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.6 
 
 
255 aa  238  8e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50 
 
 
257 aa  236  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.2 
 
 
256 aa  235  6e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.85 
 
 
263 aa  223  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.56 
 
 
209 aa  223  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.53 
 
 
263 aa  217  1e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.17 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  33.47 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  33.55 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1358  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.37 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.63625  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0744  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.37 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.638835  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0669  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.37 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0573  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.1 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  35.71 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  35.71 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  33.11 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0853  NAD(+) kinase  32.34 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000499611  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.71 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  30.07 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  34.93 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1094  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.47 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.06039  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0353  ATP-NAD/AcoX kinase  24.84 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  31.02 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  35.33 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0629  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.21 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.376086 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0877  ATP-NAD/AcoX kinase  28.42 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2628  ATP-NAD/AcoX kinase  24.17 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0843038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  29.87 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  30.49 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  31.82 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0297  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  25.18 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.33 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1137  ATP-NAD/AcoX kinase  33.15 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3791  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  32.26 
 
 
290 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3334  NAD(+)/NADH kinase family protein  28.93 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.78 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.71 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1700  NAD(+) kinase  32.43 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580359  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.79 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.78 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.22 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0019  putative NAD+ kinase  33.33 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  33.11 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0657  NAD(+) kinase  28.36 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2409  ATP-NAD/AcoX kinase  29.33 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.22 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0581  ATP-NAD/AcoX kinase  32.47 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  35.54 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1238  NAD(+) kinase  30.23 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0680  NAD(+)/NADH kinase  34.62 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0794  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.75 
 
 
340 aa  67  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0668234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  32.45 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.78 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1898  ATP-NAD/AcoX kinase  30.59 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000307238  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04330  ATP-NAD kinase  27.74 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1702  NAD(+) kinase  31.72 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1051  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.84 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.22 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1276  NAD(+) kinase  35.29 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>