More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3856 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
274 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  87.25 
 
 
259 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  88.59 
 
 
259 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  88.72 
 
 
259 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  80.99 
 
 
259 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.14 
 
 
261 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.54 
 
 
259 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  65.08 
 
 
255 aa  325  7e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  62.3 
 
 
263 aa  311  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  62.4 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  62.4 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  62.4 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  61.11 
 
 
263 aa  305  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  61 
 
 
288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.85 
 
 
274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  61.35 
 
 
256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  60.16 
 
 
256 aa  298  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  61.2 
 
 
255 aa  295  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.54 
 
 
257 aa  288  7e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.26 
 
 
257 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.85 
 
 
257 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.23 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.2 
 
 
257 aa  281  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  56.22 
 
 
253 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.2 
 
 
255 aa  278  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.63 
 
 
269 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.81 
 
 
258 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  56.65 
 
 
267 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.82 
 
 
249 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.45 
 
 
255 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.13 
 
 
257 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.63 
 
 
254 aa  261  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.34 
 
 
265 aa  261  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.34 
 
 
265 aa  261  6.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.43 
 
 
254 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.43 
 
 
254 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  59.74 
 
 
233 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.79 
 
 
256 aa  255  7e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.18 
 
 
257 aa  248  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.19 
 
 
257 aa  247  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.57 
 
 
255 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.79 
 
 
261 aa  241  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.79 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.57 
 
 
258 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.07 
 
 
209 aa  228  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.86 
 
 
263 aa  227  2e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.58 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.07 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  32.54 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.52 
 
 
293 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0744  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.17 
 
 
286 aa  85.5  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.638835  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1358  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.95 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.63625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  34.87 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0669  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.17 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  29.65 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0629  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.52 
 
 
288 aa  82  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.376086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  28.51 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  37.66 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0853  NAD(+) kinase  30.69 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000499611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  34.64 
 
 
301 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1352  NAD(+) kinase  37.91 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0123507  normal  0.0209286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.19 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1028  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.72 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.2 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.93 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.48 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.36 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.93 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0353  ATP-NAD/AcoX kinase  26.17 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  32.48 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1092  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.72 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.886083  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01851  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.44 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  35.97 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  35.97 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  31.17 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0680  NAD(+)/NADH kinase  35.29 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.33 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.93 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.5 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.5 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0840  NAD(+) kinase  35.93 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.947583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.93 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  34.64 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2371  ATP-NAD/AcoX kinase  30.53 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  32.47 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.75 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0794  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.33 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0668234  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1702  NAD(+) kinase  32.41 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1137  ATP-NAD/AcoX kinase  34.93 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2481  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.48 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0581  ATP-NAD/AcoX kinase  33.71 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  30.52 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2628  ATP-NAD/AcoX kinase  29.07 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0843038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1898  ATP-NAD/AcoX kinase  32.32 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000307238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  27.11 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.33 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.33 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  35.9 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1276  NAD(+) kinase  34.84 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1700  NAD(+) kinase  31.76 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580359  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>