More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3106 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  87.25 
 
 
274 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  84.17 
 
 
259 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.63 
 
 
261 aa  435  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  85.27 
 
 
259 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  84.94 
 
 
259 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  85.66 
 
 
259 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  66.14 
 
 
255 aa  338  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  63.92 
 
 
256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  63.92 
 
 
256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  63.92 
 
 
256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  62.2 
 
 
263 aa  314  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  62.5 
 
 
288 aa  311  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  62.45 
 
 
256 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  61.26 
 
 
256 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  60.16 
 
 
263 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  62.4 
 
 
274 aa  301  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  61.66 
 
 
255 aa  299  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.94 
 
 
257 aa  286  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.18 
 
 
257 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.78 
 
 
257 aa  284  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.04 
 
 
251 aa  284  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.24 
 
 
255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.13 
 
 
257 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  54.8 
 
 
253 aa  274  9e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.29 
 
 
269 aa  271  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  58.59 
 
 
267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.85 
 
 
255 aa  268  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58 
 
 
254 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.6 
 
 
258 aa  262  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.42 
 
 
249 aa  262  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.96 
 
 
256 aa  261  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  59.65 
 
 
233 aa  258  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.57 
 
 
254 aa  255  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.35 
 
 
254 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.98 
 
 
257 aa  255  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.1 
 
 
257 aa  254  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.28 
 
 
265 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.28 
 
 
265 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.77 
 
 
261 aa  248  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.79 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.2 
 
 
257 aa  242  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.35 
 
 
258 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  46.36 
 
 
263 aa  238  5e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.56 
 
 
209 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.06 
 
 
263 aa  230  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.4 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  33.91 
 
 
253 aa  143  3e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0629  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.1 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.376086 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0744  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.13 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.638835  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1358  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.13 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.63625  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0669  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.13 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  33.55 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  33.55 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  33.16 
 
 
262 aa  82  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0353  ATP-NAD/AcoX kinase  28.1 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0853  NAD(+) kinase  31.37 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000499611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1702  NAD(+) kinase  35.17 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  35.37 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1700  NAD(+) kinase  34.46 
 
 
309 aa  79  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580359  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2628  ATP-NAD/AcoX kinase  25.42 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0843038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.5 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0019  putative NAD+ kinase  34.64 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.36 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.5 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  31.33 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.5 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.92 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1137  ATP-NAD/AcoX kinase  35.62 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3791  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.03 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  34 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.5 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.89 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  31.71 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0877  ATP-NAD/AcoX kinase  28.64 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  34 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.5 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  30.27 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0581  ATP-NAD/AcoX kinase  36.25 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0657  NAD(+) kinase  29.56 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.03 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  33.33 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.44 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1284  ATP-NAD/AcoX kinase  27.35 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0840  NAD(+) kinase  34.34 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.947583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.66 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.66 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  31.13 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1391  ATP-NAD/AcoX kinase  29.61 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.209895  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2422  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.42 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2409  ATP-NAD/AcoX kinase  32.21 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1276  NAD(+) kinase  34.19 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0816  NAD(+) kinase  27.89 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0650  conserved hypothetical protein, putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.76 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.332208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6912  ATP-NAD/AcoX kinase  33.15 
 
 
285 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  34.53 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  34.39 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.66 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1352  NAD(+) kinase  36.31 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0123507  normal  0.0209286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>