More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1407 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
257 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  94.55 
 
 
257 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  73.93 
 
 
257 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  72.53 
 
 
233 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  65.06 
 
 
258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  59.68 
 
 
263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.83 
 
 
257 aa  301  7.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  63.45 
 
 
257 aa  300  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  55.95 
 
 
255 aa  298  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  62.25 
 
 
265 aa  297  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  62.25 
 
 
265 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  56.52 
 
 
288 aa  291  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.26 
 
 
274 aa  288  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  58.06 
 
 
253 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.26 
 
 
274 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.78 
 
 
259 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  54.55 
 
 
263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.15 
 
 
261 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.73 
 
 
259 aa  279  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.05 
 
 
259 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.78 
 
 
259 aa  276  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  54.12 
 
 
256 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.4 
 
 
255 aa  275  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  53.73 
 
 
256 aa  275  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  53.73 
 
 
256 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  54.98 
 
 
255 aa  271  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  52.16 
 
 
256 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.58 
 
 
259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.56 
 
 
269 aa  265  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.84 
 
 
249 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  55.6 
 
 
267 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  50.59 
 
 
256 aa  262  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.55 
 
 
255 aa  259  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.21 
 
 
251 aa  254  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.19 
 
 
257 aa  254  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.2 
 
 
258 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.4 
 
 
255 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50 
 
 
256 aa  246  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52 
 
 
254 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52 
 
 
254 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  48.59 
 
 
257 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.59 
 
 
261 aa  235  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.15 
 
 
209 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  45.45 
 
 
256 aa  224  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.34 
 
 
263 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.62 
 
 
263 aa  210  2e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.05 
 
 
264 aa  178  8e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  36.12 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  38.96 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2370  ATP-NAD/AcoX kinase  34.67 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1358  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.56 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.63625  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0669  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.58 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0877  ATP-NAD/AcoX kinase  27.73 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0744  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.58 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.638835  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  26.57 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  36.5 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  36.5 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2050  NAD(+) kinase  33.68 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  26.52 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  28.96 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3488  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.47 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000826356 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.48 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0840  NAD(+) kinase  32.06 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.947583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.25 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0657  NAD(+) kinase  32.05 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1454  NAD(+) kinase  35.48 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0456787  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2481  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.69 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.06 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.06 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.19 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1651  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.56 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105713  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  31.94 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  34.66 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.36 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0835  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.72 
 
 
302 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.36 
 
 
298 aa  72  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0019  putative NAD+ kinase  32.54 
 
 
286 aa  72  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16881  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.72 
 
 
302 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.91 
 
 
300 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  34.64 
 
 
290 aa  72  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.19 
 
 
296 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.33 
 
 
345 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2170  ATP-NAD/AcoX kinase  32.9 
 
 
303 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00216575  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0428  hypothetical protein  33.11 
 
 
271 aa  72  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.62 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.33 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  29.61 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3217  NAD(+) kinase  32.68 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1341  NAD(+) kinase  33.12 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1912  NAD(+) kinase  34.66 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.55 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0729  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.77 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0279623  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0964  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.33 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000412128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.55 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1898  ATP-NAD/AcoX kinase  33.54 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000307238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1051  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.4 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3297  ATP-NAD/AcoX kinase  33.77 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0523073  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  35 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.33 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>