More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0517 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
269 aa  544  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  60.71 
 
 
255 aa  315  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.42 
 
 
274 aa  314  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  63.2 
 
 
288 aa  313  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.24 
 
 
255 aa  300  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.84 
 
 
251 aa  297  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  57.83 
 
 
253 aa  291  8e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.63 
 
 
274 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.29 
 
 
259 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.27 
 
 
255 aa  287  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  59.48 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.89 
 
 
254 aa  284  9e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.89 
 
 
254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.57 
 
 
259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.29 
 
 
254 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  57.25 
 
 
255 aa  280  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  57.43 
 
 
256 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.52 
 
 
261 aa  278  5e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  57.03 
 
 
256 aa  278  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  57.03 
 
 
256 aa  278  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.56 
 
 
257 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.78 
 
 
257 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.2 
 
 
259 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.16 
 
 
257 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.73 
 
 
255 aa  272  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  54.58 
 
 
263 aa  271  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.32 
 
 
249 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.07 
 
 
257 aa  270  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  56.18 
 
 
256 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.26 
 
 
258 aa  268  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.76 
 
 
259 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.58 
 
 
258 aa  268  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  55.95 
 
 
263 aa  266  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.94 
 
 
256 aa  266  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  54.18 
 
 
256 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.77 
 
 
259 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.67 
 
 
261 aa  259  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.55 
 
 
257 aa  258  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  56.58 
 
 
233 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.99 
 
 
257 aa  251  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.71 
 
 
265 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.71 
 
 
265 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.63 
 
 
257 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51 
 
 
256 aa  241  9e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57 
 
 
209 aa  236  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  44.9 
 
 
263 aa  230  2e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.8 
 
 
263 aa  228  6e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.64 
 
 
264 aa  207  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  36.41 
 
 
253 aa  153  2e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.54 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2191  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.43 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0840  NAD(+) kinase  35.63 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.947583  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  34.67 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87580  NAD kinase associated with ferric reductase  29.73 
 
 
575 aa  74.7  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.67 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.48 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1238  NAD(+) kinase  35.53 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2339  ATP-NAD/AcoX kinase  40.58 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.185835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.44 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6912  ATP-NAD/AcoX kinase  38.55 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.48 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1700  NAD(+) kinase  30.05 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580359  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.97 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1422  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  25.71 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276876  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2628  ATP-NAD/AcoX kinase  24.69 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0843038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1092  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.69 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.886083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.53 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0297  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.33 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.53 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1284  ATP-NAD/AcoX kinase  33.55 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.6 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2409  ATP-NAD/AcoX kinase  32.21 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  33.17 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.74 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.3 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1094  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  24.44 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.06039  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1028  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  28.28 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1358  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.48 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.63625  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0744  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.48 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.638835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  34.21 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  27.98 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0669  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.48 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.53 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.53 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.09 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  26.86 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.09 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0464  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.81 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1912  NAD(+) kinase  33.55 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0669  ATP-NAD/AcoX kinase  28.8 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.935643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2370  ATP-NAD/AcoX kinase  31.08 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  30 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  28.76 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0853  NAD(+) kinase  32.95 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000499611  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  31.76 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2640  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.67 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42258  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0877  ATP-NAD/AcoX kinase  26.58 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0428  hypothetical protein  35.76 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  32.43 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.39 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>