More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2254 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  100 
 
 
263 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  66.92 
 
 
263 aa  364  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  64.68 
 
 
255 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  62.6 
 
 
256 aa  325  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  62.2 
 
 
256 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  63.04 
 
 
288 aa  322  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  61.42 
 
 
256 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  61.81 
 
 
256 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  62.06 
 
 
255 aa  315  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  59.84 
 
 
256 aa  315  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.68 
 
 
257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.11 
 
 
274 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.16 
 
 
259 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.23 
 
 
261 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.71 
 
 
257 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.04 
 
 
274 aa  295  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.36 
 
 
259 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.56 
 
 
259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.94 
 
 
259 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.43 
 
 
259 aa  285  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.18 
 
 
257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.89 
 
 
257 aa  277  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  61.38 
 
 
257 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  64.04 
 
 
233 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  62 
 
 
258 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  56.57 
 
 
253 aa  276  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.76 
 
 
265 aa  273  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.76 
 
 
265 aa  273  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.6 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.02 
 
 
251 aa  263  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.99 
 
 
255 aa  256  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  55.41 
 
 
267 aa  255  6e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.18 
 
 
269 aa  254  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.79 
 
 
256 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.63 
 
 
255 aa  250  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.98 
 
 
258 aa  249  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.19 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.2 
 
 
257 aa  241  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.2 
 
 
256 aa  239  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  53.41 
 
 
254 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.42 
 
 
209 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.19 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.61 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  52.61 
 
 
254 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.31 
 
 
263 aa  207  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.69 
 
 
263 aa  207  2e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.22 
 
 
264 aa  193  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  36.07 
 
 
253 aa  153  2e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.67 
 
 
300 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  29.89 
 
 
301 aa  86.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  29.9 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.86 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2422  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.92 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.86 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0260  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.32 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0744  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.32 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0744  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.11 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.638835  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0669  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.11 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.32 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  28.41 
 
 
290 aa  82  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1358  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.67 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.63625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1040  ATP-NAD/AcoX kinase  36.81 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831572  normal  0.0555439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1238  NAD(+) kinase  34.41 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  34.3 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1579  NAD(+) kinase  32.35 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  36.94 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4415  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.98 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.34 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.98 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0581  ATP-NAD/AcoX kinase  33.75 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0353  ATP-NAD/AcoX kinase  30.92 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.96 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3488  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.4 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000826356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  32.16 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2640  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.85 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42258  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.34 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.34 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1284  ATP-NAD/AcoX kinase  35.85 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1898  ATP-NAD/AcoX kinase  28.88 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000307238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  32.68 
 
 
283 aa  79  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1094  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.71 
 
 
278 aa  79  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.06039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5420  NAD(+)/NADH kinase family protein  30.07 
 
 
298 aa  79  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.54 
 
 
300 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.54 
 
 
300 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  27.24 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.84 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0924  ATP-NAD/AcoX kinase  37.36 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000123644  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  34.23 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.5 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.63 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35817  predicted protein  34.27 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.322999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3486  ATP-NAD/AcoX kinase  29.41 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00826859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.82 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.84 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4336  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.94 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.54 
 
 
318 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  30.53 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0584  NAD(+) kinase  35.06 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.84 
 
 
344 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>