More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1335 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1335  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
261 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1663  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  90.73 
 
 
259 aa  480  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.653393  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3106  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.63 
 
 
259 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3856  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  82.14 
 
 
274 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3237  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  79.84 
 
 
259 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0627162  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5177  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  80.31 
 
 
259 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.979978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2196  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  79.46 
 
 
259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0863  NAD(+) kinase  61.3 
 
 
263 aa  327  8e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302398  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2701  NAD(+) kinase  64.17 
 
 
255 aa  325  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1643  NAD(+) kinase  63.53 
 
 
288 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6083  ATP-NAD/AcoX kinase  61.81 
 
 
256 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0484  NAD(+) kinase  61.02 
 
 
256 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0549  NAD(+) kinase  61.02 
 
 
256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0520  NAD(+) kinase  61.02 
 
 
256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.250733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2254  NAD(+) kinase  59.23 
 
 
263 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5356  NAD(+) kinase  60.24 
 
 
256 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1719  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  60.8 
 
 
274 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5026  NAD(+) kinase  61.11 
 
 
255 aa  295  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265111  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0963  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.52 
 
 
257 aa  288  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127918  hitchhiker  0.00623774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1308  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.94 
 
 
257 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951629  normal  0.0573705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3061  NAD(+) kinase  57.2 
 
 
253 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1407  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.15 
 
 
257 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809268  normal  0.698974 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0609  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.94 
 
 
257 aa  280  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1578  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.63 
 
 
251 aa  278  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1804  hypothetical protein  62.07 
 
 
233 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1772  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  59.2 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2990  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.56 
 
 
255 aa  271  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234914  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0822  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.8 
 
 
255 aa  271  7e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2250  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  58.94 
 
 
257 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.430774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.75 
 
 
269 aa  262  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.22 
 
 
249 aa  262  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1774  NAD(+) kinase  55.27 
 
 
267 aa  259  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2482  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.4 
 
 
254 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479189  normal  0.154733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0353  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.6 
 
 
254 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0825  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  54.4 
 
 
254 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0937  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.72 
 
 
265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0932  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.72 
 
 
265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1656  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.78 
 
 
256 aa  252  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.739185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1521  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.99 
 
 
257 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2604  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.59 
 
 
257 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37131  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0830  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51.79 
 
 
255 aa  244  9e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0935  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  51 
 
 
256 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0783  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  47.49 
 
 
263 aa  240  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.897592  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1984  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  49.21 
 
 
261 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  50.79 
 
 
258 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1840  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  56.04 
 
 
209 aa  228  7e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0225  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  45.38 
 
 
263 aa  226  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0871  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.08 
 
 
264 aa  192  4e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.93065  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0310  putative ATP-NAD kinase  34.38 
 
 
253 aa  143  3e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.634813  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2628  ATP-NAD/AcoX kinase  26.05 
 
 
289 aa  87  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0843038  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  32.98 
 
 
284 aa  86.3  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0629  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.14 
 
 
288 aa  85.9  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.376086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0853  NAD(+) kinase  34.17 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000499611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  34.21 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.27 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1700  NAD(+) kinase  34.87 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580359  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  35.93 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0744  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.16 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.638835  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1702  NAD(+) kinase  34.9 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3081  ATP-NAD/AcoX kinase  35.81 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0669  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.16 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1358  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.59 
 
 
286 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.63625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  32.69 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0877  ATP-NAD/AcoX kinase  26.77 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1028  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  26.58 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  31.35 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  30.72 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0353  ATP-NAD/AcoX kinase  27.7 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1092  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  26.58 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.886083  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1785  NAD(+)/NADH kinase  31.01 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.422764  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1391  ATP-NAD/AcoX kinase  29.39 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.209895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0657  NAD(+) kinase  29.85 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0019  putative NAD+ kinase  32 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1238  NAD(+) kinase  30.52 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1276  NAD(+) kinase  37.66 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0581  ATP-NAD/AcoX kinase  36.54 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  34.44 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  32.72 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  32.12 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1137  ATP-NAD/AcoX kinase  35.06 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1333  ATP-NAD/AcoX kinase  28.12 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0840  NAD(+) kinase  31.13 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.947583  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2165  ATP-NAD/AcoX kinase  30.26 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2071  NAD(+)/NADH kinase  30.92 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.323141  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87580  NAD kinase associated with ferric reductase  29.11 
 
 
575 aa  73.6  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  29.68 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2409  ATP-NAD/AcoX kinase  30.67 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  30.26 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  35 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  36.54 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1284  ATP-NAD/AcoX kinase  31.41 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0816  NAD(+) kinase  32.89 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.1 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  35 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.71 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004294  NAD kinase  35.06 
 
 
294 aa  72  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  33.33 
 
 
288 aa  72  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  27.42 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2808  ATP-NAD/AcoX kinase  30.67 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1040  ATP-NAD/AcoX kinase  33.33 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831572  normal  0.0555439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>