More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1454 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1454  NAD(+) kinase  100 
 
 
273 aa  539  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0456787  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1246  NAD(+) kinase  41.04 
 
 
296 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.641624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1658  ATP-NAD/AcoX kinase  39.46 
 
 
290 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.059696  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06550  ATP-NAD/AcoX kinase  33.33 
 
 
260 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000264989  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  33.1 
 
 
301 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  35.51 
 
 
301 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  30.52 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0900  ATP-NAD/AcoX kinase  43.3 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000200756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  35.16 
 
 
285 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2681  ATP-NAD/AcoX kinase  36.82 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2191  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.49 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.91 
 
 
300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.36 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0941  ATP-NAD/AcoX kinase  34.44 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2356  ATP-NAD/AcoX kinase  36.89 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0719197  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.36 
 
 
300 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.36 
 
 
345 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.36 
 
 
345 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.91 
 
 
299 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.91 
 
 
300 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2409  ATP-NAD/AcoX kinase  32.47 
 
 
287 aa  125  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  35.78 
 
 
293 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  31.58 
 
 
285 aa  125  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5440  NAD(+) kinase  39.7 
 
 
300 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175951  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  37.9 
 
 
309 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  26.84 
 
 
284 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0775  ATP-NAD/AcoX kinase  34.59 
 
 
282 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0146172  normal  0.735032 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0428  hypothetical protein  37.75 
 
 
271 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2876  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.16 
 
 
295 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1391  ATP-NAD/AcoX kinase  31.1 
 
 
257 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.209895  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.91 
 
 
300 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2738  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.16 
 
 
295 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1341  NAD(+) kinase  37.32 
 
 
343 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22140  predicted sugar kinase  36.78 
 
 
327 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218778  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  35.74 
 
 
278 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  34.73 
 
 
303 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.91 
 
 
300 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.45 
 
 
300 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.91 
 
 
344 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.91 
 
 
320 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0902  NAD(+) kinase  35.35 
 
 
269 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00230325  normal  0.504909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.45 
 
 
300 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.45 
 
 
300 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3026  ATP-NAD/AcoX kinase  40.09 
 
 
308 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.241982 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1108  ATP-NAD/AcoX kinase  34.25 
 
 
280 aa  122  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  35 
 
 
300 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2640  NAD(+)/NADH kinase family protein  35 
 
 
300 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42258  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  36.07 
 
 
290 aa  122  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1040  ATP-NAD/AcoX kinase  35.32 
 
 
286 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831572  normal  0.0555439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0260  NAD(+)/NADH kinase family protein  35 
 
 
300 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0744  NAD(+)/NADH kinase family protein  35 
 
 
300 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  35.62 
 
 
282 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2065  ATP-NAD kinase  32.44 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0428793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  31.43 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1509  NAD(+) kinase  35.48 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0731  NAD(+) kinase  35.62 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5420  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.48 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  35.16 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0816  NAD(+) kinase  31.18 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2422  NAD(+)/NADH kinase family protein  35.91 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  30.43 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0379  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.68 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.520886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3011  ATP-NAD/AcoX kinase  36.18 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14301  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.51 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2050  NAD(+) kinase  32.13 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1903  NAD(+) kinase  37.67 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.77883  hitchhiker  0.0000218003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  35.62 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1517  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.1 
 
 
340 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2072  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.77 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0584  NAD(+) kinase  32.73 
 
 
268 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0853  NAD(+) kinase  34.36 
 
 
278 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000499611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1692  ATP-NAD/AcoX kinase  29.17 
 
 
286 aa  118  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.121225  hitchhiker  0.00242245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.67 
 
 
292 aa  118  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131242  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1591  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase, putative  28.89 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2618  NAD(+) kinase  33.89 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2471  ATP-NAD/AcoX kinase  34.76 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.462719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1523  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.04 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  31.96 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0611  ATP-dependent NAD kinase  33.18 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2165  ATP-NAD/AcoX kinase  31.82 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2438  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.59 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  39.55 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2808  ATP-NAD/AcoX kinase  31.22 
 
 
288 aa  116  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0629  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.34 
 
 
288 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.376086 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1190  NAD(+) kinase  37.19 
 
 
293 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1912  NAD(+) kinase  37.61 
 
 
308 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1516  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.21 
 
 
346 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000349412 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2071  NAD(+)/NADH kinase  26.37 
 
 
276 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.323141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2792  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.56 
 
 
309 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000237572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  30.28 
 
 
288 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2033  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.1 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14541  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.74 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0915  NAD(+) kinase  28.83 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.895385  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1521  ATP-NAD/AcoX kinase  28.18 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0965149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4438  ATP-NAD/AcoX kinase  37.91 
 
 
297 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0396483  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1593  ATP-NAD/AcoX kinase  39.52 
 
 
276 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00364433  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.29 
 
 
309 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000296073  normal  0.942574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2806  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.29 
 
 
309 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126891  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.29 
 
 
309 aa  116  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000229952  normal  0.0349698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13660  predicted sugar kinase  37.38 
 
 
314 aa  115  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>