58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2829 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  364  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  52.73 
 
 		 1227 aa  141  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  55.04 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  54.62 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  48.82 
 
 		 1461 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  48.82 
 
 		 214 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  46.92 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  46.67 
 
 		 485 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  45.08 
 
 		 126 aa  94.4  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  44.53 
 
 		 839 aa  91.7  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  41.18 
 
 		 119 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  37.27 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  37.27 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  37.27 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  37.27 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  37.27 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  37.27 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  37.27 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  37.27 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  34.69 
 
 		 130 aa  67  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  33.67 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  32.89 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  33.62 
 
 		 556 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  42.62 
 
 		 324 aa  65.1  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  39.39 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  32.43 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  31 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  32.43 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  36.51 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  32.43 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  32.43 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  36.22 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  31.53 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  31.53 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  31.53 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  38.54 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  34.13 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  35.2 
 
 		 387 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  35.92 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  29.59 
 
 		 128 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  34.62 
 
 		 540 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  27.55 
 
 		 128 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  36.54 
 
 		 119 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  30.61 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  29.63 
 
 		 130 aa  47.8  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  31.25 
 
 		 430 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  33.71 
 
 		 328 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7561  hypothetical protein  29.35 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0385242  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3114  hypothetical protein  28.06 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212423  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3469  hypothetical protein  28.06 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3554  hypothetical protein  32.29 
 
 		 121 aa  41.2  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3425  hypothetical protein  32.29 
 
 		 121 aa  41.2  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>