52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0859 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  234  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  90.76 
 
 
130 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  90.76 
 
 
130 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  90.76 
 
 
130 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  90.76 
 
 
130 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  90.76 
 
 
130 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  90.76 
 
 
130 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  44.35 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  44.35 
 
 
130 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  42.48 
 
 
129 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  40.87 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  47 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  39.13 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  41.18 
 
 
180 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  43.53 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  40.66 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0032  hypothetical protein  38.84 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  40.18 
 
 
387 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  34.65 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  34.65 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  34.65 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  34.65 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  41.94 
 
 
389 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  42.72 
 
 
363 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  34.65 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  34.65 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  34.65 
 
 
126 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  41.38 
 
 
361 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  36.36 
 
 
1227 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  35.79 
 
 
237 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  36.36 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  33.33 
 
 
556 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  33.33 
 
 
328 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  33.02 
 
 
839 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4350  hypothetical protein  38.53 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00663093  normal  0.0999506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  39.77 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  31.37 
 
 
1461 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  34.34 
 
 
485 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0236  hypothetical protein  32.93 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0027  hypothetical protein  36.67 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  33.01 
 
 
373 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  34.09 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  31.31 
 
 
214 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>