29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3870 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  249  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  89.08 
 
 		 119 aa  228  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  40.34 
 
 		 430 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  37.07 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  41.07 
 
 		 556 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  38.14 
 
 		 373 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  34.82 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  35.92 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  36.61 
 
 		 389 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  29.75 
 
 		 328 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7561  hypothetical protein  34.58 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0385242  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  38.2 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  34.48 
 
 		 387 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  34.52 
 
 		 363 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  30.1 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  35 
 
 		 540 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  36.67 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  34.31 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  30.77 
 
 		 361 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  31.73 
 
 		 408 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  33.7 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  30.91 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  34.09 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  31.53 
 
 		 126 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  32.67 
 
 		 324 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  31.96 
 
 		 214 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  31.96 
 
 		 1461 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  32.99 
 
 		 485 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  35.96 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>