31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0173 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  811    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  50.69 
 
 
363 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  49.73 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  42.27 
 
 
389 aa  256  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  57.04 
 
 
328 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  48.12 
 
 
153 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3469  hypothetical protein  42.65 
 
 
333 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3114  hypothetical protein  42.65 
 
 
333 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212423  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  36.69 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  37.23 
 
 
1461 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  36.76 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  37.5 
 
 
126 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  37.23 
 
 
485 aa  67  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  40.18 
 
 
119 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  36.36 
 
 
839 aa  60.5  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  35.25 
 
 
222 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  29.93 
 
 
373 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  35.2 
 
 
180 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  31.3 
 
 
324 aa  53.5  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  28.57 
 
 
430 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  37.78 
 
 
130 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  37.78 
 
 
130 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  37.78 
 
 
130 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  34.48 
 
 
119 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  37.78 
 
 
130 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  37.78 
 
 
130 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  37.78 
 
 
130 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  30.89 
 
 
119 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  31.09 
 
 
556 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  31.97 
 
 
1586 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  28.97 
 
 
118 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>