42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1193 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  100 
 
 		 556 aa  1123    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  45.95 
 
 		 430 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0922  hypothetical protein  38.24 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  38.39 
 
 		 118 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  41.18 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  41.07 
 
 		 119 aa  73.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7561  hypothetical protein  37.61 
 
 		 141 aa  72  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0385242  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  40.54 
 
 		 540 aa  70.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  37.04 
 
 		 119 aa  67  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  33.62 
 
 		 180 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  39.13 
 
 		 222 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  37.82 
 
 		 839 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  38.53 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  39.22 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  34.19 
 
 		 126 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1461 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2586  hypothetical protein  31.47 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000365583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  34.91 
 
 		 131 aa  57.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1838  hypothetical protein  30.65 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  37.25 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  37.61 
 
 		 130 aa  57  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  34.23 
 
 		 485 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  34.17 
 
 		 129 aa  54.7  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  38.53 
 
 		 214 aa  53.9  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  52  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.03 
 
 		 3020 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  33.94 
 
 		 128 aa  50.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1227 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  33.03 
 
 		 128 aa  47.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  34.95 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  31.09 
 
 		 387 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  30.19 
 
 		 130 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0929  hypothetical protein  27.63 
 
 		 307 aa  44.3  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000192254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  37.74 
 
 		 130 aa  43.9  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>