40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3783 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  264  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  74.42 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  72.87 
 
 		 128 aa  193  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  67.69 
 
 		 130 aa  183  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  68.46 
 
 		 130 aa  164  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  61.83 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  51.54 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  50.77 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0032  hypothetical protein  40.44 
 
 		 136 aa  87.4  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  40.62 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  40.62 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  40.62 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  40.62 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  40.62 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  40.62 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  39.84 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  40.87 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0027  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  34.58 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0236  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869279  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  30.61 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  32.35 
 
 		 464 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  33.7 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3425  hypothetical protein  30.1 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3554  hypothetical protein  30.1 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  30.19 
 
 		 556 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  28.97 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>