34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0032 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0032  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  264  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0027  hypothetical protein  60 
 
 
137 aa  147  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  47.79 
 
 
130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  46.32 
 
 
128 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  45.59 
 
 
128 aa  110  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  47.79 
 
 
131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  41.18 
 
 
130 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  39.71 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  45.59 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  40.5 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  37.14 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  37.14 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  37.14 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  37.14 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  37.14 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  37.14 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  37.14 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  36.43 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  41.18 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  41.18 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  41.18 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  41.18 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  41.18 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  41.18 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  41.18 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  38.24 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  38.24 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  38.24 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  38.24 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  38.24 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  38.24 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  34.83 
 
 
180 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0236  hypothetical protein  44.83 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  32.08 
 
 
237 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>