39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0206 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  259  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  85.16 
 
 		 128 aa  226  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  82.17 
 
 		 130 aa  209  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  74.42 
 
 		 130 aa  201  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  78.29 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  70 
 
 		 131 aa  173  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  53.12 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  50.39 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  49.61 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  49.61 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  49.61 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  49.61 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  49.61 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  49.61 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  49.61 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0032  hypothetical protein  45.65 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  45.53 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  45.53 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  45.53 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  45.53 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  45.53 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  45.53 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  45.53 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0027  hypothetical protein  38.06 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0236  hypothetical protein  42.05 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  32.71 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  27.55 
 
 		 180 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3554  hypothetical protein  31.13 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3425  hypothetical protein  31.13 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  33.94 
 
 		 556 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  34 
 
 		 464 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  26.42 
 
 		 328 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>