48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4078 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  308  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  51.39 
 
 		 237 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  51.47 
 
 		 222 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  44.1 
 
 		 363 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  48.12 
 
 		 387 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  46.92 
 
 		 180 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  45.21 
 
 		 1227 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  45.9 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  44.59 
 
 		 361 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1461 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  41.45 
 
 		 485 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  41.45 
 
 		 214 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  42.38 
 
 		 389 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  44.97 
 
 		 839 aa  88.2  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  47 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  43.97 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  37.5 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  30.92 
 
 		 373 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4350  hypothetical protein  34.13 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00663093  normal  0.0999506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  33.03 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  34.58 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  32.71 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  32.71 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  37.04 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  33.64 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3114  hypothetical protein  43.52 
 
 		 333 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212423  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3469  hypothetical protein  43.52 
 
 		 333 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  31.3 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  31.3 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  31.3 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  31.3 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  31.3 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  31.3 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  31.3 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  31.3 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1586 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  32.04 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  41.28 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  41.28 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  41.28 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  41.28 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  41.28 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  41.28 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  33.64 
 
 		 408 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3380  hypothetical protein  35.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  31.78 
 
 		 464 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  30.91 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  30.91 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>