50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3169 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  59.55 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  55.04 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  52.59 
 
 		 1227 aa  128  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  51.47 
 
 		 153 aa  114  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  50 
 
 		 485 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  46.51 
 
 		 1461 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  48.84 
 
 		 839 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  40.37 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  39.34 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  46.21 
 
 		 324 aa  78.6  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  36.81 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  40.17 
 
 		 361 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  40.66 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  35.46 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  36.15 
 
 		 556 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  35.25 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  30.48 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  34.31 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  34.31 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  34.31 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  34.31 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  34.31 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  34.31 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  34.31 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  34.31 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  35.88 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3380  hypothetical protein  41.98 
 
 		 77 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  33.02 
 
 		 118 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  31.93 
 
 		 126 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  31.93 
 
 		 126 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  31.93 
 
 		 126 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  31.93 
 
 		 126 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  31.09 
 
 		 126 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  31.09 
 
 		 126 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  31.09 
 
 		 126 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  38.83 
 
 		 130 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  38.83 
 
 		 130 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  38.83 
 
 		 130 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  38.83 
 
 		 130 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  38.83 
 
 		 130 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  38.83 
 
 		 130 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  34.12 
 
 		 1586 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  32.32 
 
 		 464 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  34.31 
 
 		 119 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  33.01 
 
 		 119 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  32.18 
 
 		 130 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4350  hypothetical protein  35.19 
 
 		 131 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00663093  normal  0.0999506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>