43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2870 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  259  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  85.16 
 
 
128 aa  226  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  75.19 
 
 
130 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  72.87 
 
 
130 aa  193  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  72.09 
 
 
130 aa  172  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  69.23 
 
 
131 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  52.34 
 
 
129 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  50.39 
 
 
129 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  50.39 
 
 
129 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  50.39 
 
 
129 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  50.39 
 
 
129 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  50.39 
 
 
129 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  50.39 
 
 
129 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  50.39 
 
 
129 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  49.61 
 
 
129 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  47.15 
 
 
126 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  47.15 
 
 
126 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  47.15 
 
 
126 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  47.15 
 
 
126 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  47.15 
 
 
126 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  47.15 
 
 
126 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  47.15 
 
 
126 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0032  hypothetical protein  42.86 
 
 
136 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0027  hypothetical protein  36.57 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  39.13 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0236  hypothetical protein  42.7 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869279  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  35.38 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  35.38 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3554  hypothetical protein  32 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3425  hypothetical protein  32 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  35.38 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  35.38 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  35.38 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  35.38 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  32.71 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  29.59 
 
 
180 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  33.03 
 
 
556 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  34 
 
 
464 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  34.02 
 
 
430 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  30.84 
 
 
1227 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  25.66 
 
 
328 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  35.96 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  30.53 
 
 
222 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>