38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0928 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  100 
 
 
1227 aa  2395    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  52.73 
 
 
180 aa  141  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  52.59 
 
 
222 aa  128  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  52 
 
 
839 aa  106  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  47.37 
 
 
237 aa  105  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  45.21 
 
 
153 aa  101  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  44 
 
 
1461 aa  95.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  44 
 
 
214 aa  95.1  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  40.12 
 
 
485 aa  92.8  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2830  hypothetical protein  23.64 
 
 
1090 aa  78.2  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  36.51 
 
 
126 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  43.75 
 
 
324 aa  66.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  33.06 
 
 
373 aa  56.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  55.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  36.36 
 
 
119 aa  54.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  52  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  52  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  51.6  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  31.58 
 
 
556 aa  48.5  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  37.23 
 
 
361 aa  47.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  28.97 
 
 
129 aa  47.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  35.24 
 
 
389 aa  47  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  34.69 
 
 
118 aa  46.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7561  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  46.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0385242  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3380  hypothetical protein  41.56 
 
 
77 aa  45.8  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  30.84 
 
 
130 aa  45.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>