52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2036 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  257  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  257  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  257  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  257  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  257  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  257  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  90.76 
 
 
119 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  40.77 
 
 
131 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  40.62 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  42.31 
 
 
130 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  37.69 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  43.12 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  37.4 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  37.4 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  37.4 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  37.4 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  37.4 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  37.4 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  37.4 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  37.4 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  36.92 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  36.92 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  41.96 
 
 
387 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  40 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  38.83 
 
 
222 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0032  hypothetical protein  38.24 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  42.31 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  41.18 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  43.18 
 
 
361 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  40.86 
 
 
389 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  33.07 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  33.07 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  33.07 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  33.07 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  33.07 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  33.07 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  33.07 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4350  hypothetical protein  35.9 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00663093  normal  0.0999506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  35.92 
 
 
126 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  35.24 
 
 
556 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  33.98 
 
 
328 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  32.79 
 
 
1227 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  33.68 
 
 
237 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  33.66 
 
 
839 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  39.77 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  36.17 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  34.34 
 
 
485 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  36.17 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  30.39 
 
 
1461 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0236  hypothetical protein  34.15 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869279  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  34 
 
 
373 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0027  hypothetical protein  34.07 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>