23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2437 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  687    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  48.57 
 
 
363 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  57.53 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  57.04 
 
 
387 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  59.73 
 
 
361 aa  152  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3469  hypothetical protein  47.76 
 
 
333 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3114  hypothetical protein  47.76 
 
 
333 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212423  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  43.97 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  36.23 
 
 
485 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  33.59 
 
 
237 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  35.88 
 
 
222 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  29.75 
 
 
119 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  29.75 
 
 
119 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  30.99 
 
 
214 aa  52.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  30.99 
 
 
1461 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  32.28 
 
 
126 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  28.57 
 
 
373 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  28.45 
 
 
430 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  33.71 
 
 
180 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  34.4 
 
 
839 aa  46.6  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  30.08 
 
 
324 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>