31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0540 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  808    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  49.87 
 
 		 363 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  50.42 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  41.69 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  57.53 
 
 		 328 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  44.74 
 
 		 153 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3469  hypothetical protein  47.37 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3114  hypothetical protein  47.37 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212423  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  37.12 
 
 		 1461 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  40.43 
 
 		 237 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  37.12 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  36.81 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  43.52 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  38.76 
 
 		 839 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  36.36 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  36.52 
 
 		 119 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  36.61 
 
 		 119 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  27.64 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  34.13 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  30.3 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1227 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  37.93 
 
 		 130 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  37.93 
 
 		 130 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  37.93 
 
 		 130 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  37.93 
 
 		 130 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  37.93 
 
 		 130 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  30.25 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  37.93 
 
 		 130 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  32.73 
 
 		 131 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4350  hypothetical protein  30.97 
 
 		 131 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00663093  normal  0.0999506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>