13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3380 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3380  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  90.91 
 
 
324 aa  154  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  45.57 
 
 
485 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  36.71 
 
 
1461 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  41.77 
 
 
373 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  36.71 
 
 
214 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  41.98 
 
 
222 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  40.74 
 
 
237 aa  52  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  38.75 
 
 
839 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  41.56 
 
 
1227 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  35.8 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  36.71 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  41.56 
 
 
180 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>