52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03070 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  100 
 
 		 1461 aa  3031    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  40.93 
 
 		 485 aa  310  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  39.82 
 
 		 839 aa  281  9e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  51.18 
 
 		 373 aa  123  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  50.4 
 
 		 126 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  48.82 
 
 		 180 aa  112  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  52.71 
 
 		 237 aa  110  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  46.51 
 
 		 222 aa  106  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  43.75 
 
 		 153 aa  97.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  44 
 
 		 1227 aa  95.9  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  38.5 
 
 		 324 aa  92.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  37.12 
 
 		 389 aa  75.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  36.03 
 
 		 361 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  37.23 
 
 		 387 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  34.56 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  22.83 
 
 		 875 aa  61.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  33.58 
 
 		 556 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3380  hypothetical protein  36.71 
 
 		 77 aa  58.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  30.63 
 
 		 118 aa  56.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3469  hypothetical protein  34.68 
 
 		 333 aa  55.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3114  hypothetical protein  34.68 
 
 		 333 aa  55.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212423  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  52.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  52.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  30.1 
 
 		 126 aa  52.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  52.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  52.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  52.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  30.1 
 
 		 126 aa  52.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  52.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  30.1 
 
 		 126 aa  52.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  30.1 
 
 		 126 aa  52.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  52.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  30.1 
 
 		 126 aa  52  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  37.37 
 
 		 430 aa  52  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  31.86 
 
 		 129 aa  52  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  30.1 
 
 		 126 aa  52  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  30.99 
 
 		 328 aa  50.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  29.13 
 
 		 126 aa  50.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  35.51 
 
 		 540 aa  48.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  33.64 
 
 		 131 aa  48.5  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  23.87 
 
 		 953 aa  47.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0113  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1085 aa  46.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  27.83 
 
 		 130 aa  47  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  46.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  23.05 
 
 		 996 aa  46.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  34.31 
 
 		 464 aa  45.8  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  31.37 
 
 		 119 aa  45.8  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  23.05 
 
 		 996 aa  45.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  23.87 
 
 		 870 aa  45.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4350  hypothetical protein  37.86 
 
 		 131 aa  45.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00663093  normal  0.0999506 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003065  membrane protein putative  27.65 
 
 		 1173 aa  45.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>