45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26550 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  261  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  51.54 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  53.12 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  52.34 
 
 
128 aa  130  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  51.54 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  48.85 
 
 
131 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  48.41 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  47.62 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  47.62 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  47.62 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  47.62 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  47.62 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  47.62 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  47.62 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  46.92 
 
 
130 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  44.8 
 
 
126 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  44.8 
 
 
126 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  44.8 
 
 
126 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  44.8 
 
 
126 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  44.8 
 
 
126 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  44.8 
 
 
126 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  44.8 
 
 
126 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  42.48 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0236  hypothetical protein  48.28 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0032  hypothetical protein  39.71 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  39.84 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  39.84 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  39.84 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  39.84 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  39.84 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  39.84 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  31 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  30.48 
 
 
222 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  34.17 
 
 
556 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0027  hypothetical protein  31.25 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  32.04 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  29.59 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  30.19 
 
 
237 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  35.71 
 
 
373 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  28.97 
 
 
1227 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  29.41 
 
 
1461 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  36.36 
 
 
430 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  29.29 
 
 
214 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3554  hypothetical protein  30.1 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3425  hypothetical protein  30.1 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>