50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0535 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  256  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  74.05 
 
 		 130 aa  191  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  70 
 
 		 128 aa  173  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  69.23 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  73.28 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  61.83 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  48.85 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  53.44 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  53.44 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  53.44 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  53.44 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  53.44 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  53.44 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  53.44 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  52.67 
 
 		 129 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0032  hypothetical protein  46.32 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  44.35 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  52.94 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  52.94 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  52.94 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  52.94 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  52.94 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  52.94 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  51.96 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0027  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  33.67 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0236  hypothetical protein  45.45 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869279  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  40.77 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  40.77 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  40.77 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  40.77 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  40.77 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  40.77 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  33.03 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3425  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3554  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  34.91 
 
 		 556 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1227 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1461 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  36.56 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  32.71 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  36.67 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  32.67 
 
 		 485 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  30.68 
 
 		 237 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  32.41 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  30.84 
 
 		 839 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4350  hypothetical protein  43.1 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00663093  normal  0.0999506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>