29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  760    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  49.86 
 
 
387 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  49.87 
 
 
389 aa  328  7e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  50.87 
 
 
361 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  48.57 
 
 
328 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  44.1 
 
 
153 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3469  hypothetical protein  42.52 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3114  hypothetical protein  42.52 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212423  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  37.68 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  32.26 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  35.46 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  36 
 
 
126 aa  67  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  35.88 
 
 
485 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  34.56 
 
 
1461 aa  62.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  42.72 
 
 
119 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  36.51 
 
 
180 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  28.47 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  35.77 
 
 
839 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  31.16 
 
 
324 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  34.52 
 
 
119 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  34.48 
 
 
119 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  29.76 
 
 
430 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  42.19 
 
 
130 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  42.19 
 
 
130 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  42.19 
 
 
130 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  42.19 
 
 
130 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  42.19 
 
 
130 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  42.19 
 
 
130 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  30.97 
 
 
1586 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>