22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0413 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  100 
 
 
839 aa  1737    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  39.82 
 
 
1461 aa  281  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  35.42 
 
 
485 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  59.16 
 
 
214 aa  213  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  52 
 
 
1227 aa  106  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  48.84 
 
 
222 aa  104  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  48.89 
 
 
237 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  47.97 
 
 
126 aa  94  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  44.53 
 
 
180 aa  91.7  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  40.8 
 
 
373 aa  90.9  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  44.97 
 
 
153 aa  88.2  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  40.77 
 
 
324 aa  76.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  37.82 
 
 
556 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  38.76 
 
 
389 aa  63.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  38.69 
 
 
361 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0085  hypothetical protein  60.87 
 
 
55 aa  61.2  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  36.36 
 
 
387 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  35.77 
 
 
363 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3380  hypothetical protein  38.75 
 
 
77 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  33.02 
 
 
119 aa  48.5  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  34.4 
 
 
328 aa  46.6  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  29.9 
 
 
118 aa  46.6  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>