51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0801 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  99.22 
 
 
129 aa  256  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  50.39 
 
 
128 aa  124  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  51.54 
 
 
130 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  53.12 
 
 
126 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  53.12 
 
 
126 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  53.12 
 
 
126 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  53.12 
 
 
126 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  53.44 
 
 
131 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  53.12 
 
 
126 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  53.12 
 
 
126 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  52.34 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  49.61 
 
 
128 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  47.62 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  48.46 
 
 
130 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0236  hypothetical protein  50.56 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3554  hypothetical protein  44.63 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  39.13 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3425  hypothetical protein  44.63 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  37.27 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  30.77 
 
 
1227 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0032  hypothetical protein  37.96 
 
 
136 aa  58.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  34.31 
 
 
222 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  38.24 
 
 
556 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  32.86 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  32.86 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  32.86 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  32.86 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  32.86 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  32.86 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  33.64 
 
 
464 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  32.74 
 
 
1461 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  31.3 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  32.65 
 
 
237 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  34 
 
 
430 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  32.71 
 
 
118 aa  50.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  31.13 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  32.74 
 
 
214 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0027  hypothetical protein  28.43 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  35.05 
 
 
373 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  27.43 
 
 
408 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  30 
 
 
839 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  30.91 
 
 
485 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  30.84 
 
 
540 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>