28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3469 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3469  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  683    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3114  hypothetical protein  99.4 
 
 		 333 aa  680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212423  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  47.76 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  40.38 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  44.09 
 
 		 363 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  47.37 
 
 		 389 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  46.46 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  43.52 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  36.29 
 
 		 1461 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  35.71 
 
 		 214 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  35.71 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  34.64 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  37.4 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  40.52 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  33.96 
 
 		 131 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  29.87 
 
 		 180 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  34.15 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  30.84 
 
 		 130 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  30.95 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1227 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  30.36 
 
 		 119 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  31.86 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  30.91 
 
 		 128 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  31.82 
 
 		 129 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  24.82 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  31.82 
 
 		 130 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  30.46 
 
 		 464 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>