47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06817 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  100 
 
 		 1461 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  59.9 
 
 		 485 aa  248  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  59.16 
 
 		 839 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  50.78 
 
 		 373 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  41.94 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  48.82 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  50.4 
 
 		 126 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  40.37 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  38.3 
 
 		 324 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  44 
 
 		 1227 aa  95.5  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  41.45 
 
 		 153 aa  92.8  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  36.69 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  32.26 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  37.12 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  36.03 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3380  hypothetical protein  36.71 
 
 		 77 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  38.26 
 
 		 556 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  37.37 
 
 		 430 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  30.63 
 
 		 118 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  30.99 
 
 		 328 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3114  hypothetical protein  34.13 
 
 		 333 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212423  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3469  hypothetical protein  34.13 
 
 		 333 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  35.51 
 
 		 540 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  32.71 
 
 		 131 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 464 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  29.63 
 
 		 126 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  29.63 
 
 		 126 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  29.63 
 
 		 126 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  29.63 
 
 		 126 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  31.86 
 
 		 129 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  29.41 
 
 		 130 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  29.63 
 
 		 126 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  29.63 
 
 		 126 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  29.29 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  28.7 
 
 		 126 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  31.96 
 
 		 119 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4350  hypothetical protein  40.45 
 
 		 131 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00663093  normal  0.0999506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  31.96 
 
 		 119 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  50.94 
 
 		 408 aa  41.6  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>