32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4427 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  42.74 
 
 		 430 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  38.39 
 
 		 556 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  37.07 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  35.34 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7561  hypothetical protein  32.71 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0385242  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  32.43 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  38.54 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  35.85 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1461 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  37.04 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  32.43 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  33.02 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  30.63 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  32.71 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  32.71 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  32.71 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  32.71 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  32.71 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  32.71 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  32.71 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  32.71 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  36.56 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  39.77 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  35.78 
 
 		 408 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  29.9 
 
 		 839 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1227 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  35.05 
 
 		 540 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  36.56 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  28.97 
 
 		 387 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  30.1 
 
 		 464 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>